More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1120 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  100 
 
 
99 aa  199  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  74.73 
 
 
95 aa  134  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  73.91 
 
 
95 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  69.89 
 
 
98 aa  131  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  70.53 
 
 
97 aa  131  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  77.27 
 
 
92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  67.35 
 
 
100 aa  127  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000271812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  67.35 
 
 
100 aa  127  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1182  50S ribosomal protein L27  69.66 
 
 
94 aa  126  8.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0143034  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2459  50S ribosomal protein L27  75.29 
 
 
85 aa  126  9.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.177847 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1548  ribosomal protein L27  74.12 
 
 
85 aa  124  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104993  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2181  50S ribosomal protein L27  75.61 
 
 
88 aa  123  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.188028  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl439  50S ribosomal protein L27  66.32 
 
 
95 aa  123  8.000000000000001e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583794  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  75 
 
 
87 aa  122  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  71.74 
 
 
94 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  73.49 
 
 
86 aa  123  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0414  50S ribosomal protein L27  66.3 
 
 
93 aa  121  3e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0656018  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0764  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 
85 aa  120  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191049  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7270  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 
85 aa  120  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  70 
 
 
93 aa  120  9e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  68.18 
 
 
90 aa  119  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0896  ribosomal protein L27  63.04 
 
 
92 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000144427  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0757  50S ribosomal protein L27  74.07 
 
 
97 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.819574  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  63.44 
 
 
93 aa  118  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3450  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 
84 aa  118  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14110  ribosomal protein L27  69.66 
 
 
92 aa  117  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254683  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2060  ribosomal protein L27  67.82 
 
 
87 aa  117  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3480  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
84 aa  117  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.219876  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0746  50S ribosomal protein L27  67.42 
 
 
103 aa  117  7e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122269  hitchhiker  0.000403944 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1815  ribosomal protein L27  67.39 
 
 
102 aa  117  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1735  50S ribosomal protein L27  65.59 
 
 
94 aa  117  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000015343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1702  50S ribosomal protein L27  65.59 
 
 
94 aa  117  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000326176  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3456  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
85 aa  116  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225888  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  65.52 
 
 
87 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
87 aa  116  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1524  50S ribosomal protein L27  74.07 
 
 
86 aa  115  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.846788  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0456  50S ribosomal protein L27  65.22 
 
 
96 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.031206  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1209  50S ribosomal protein L27  64.52 
 
 
94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000066933  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1368  50S ribosomal protein L27  66.29 
 
 
94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000272527  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10120  LSU ribosomal protein L27P  67.06 
 
 
85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28486  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2534  50S ribosomal protein L27  71.76 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00269432  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0910  50S ribosomal protein L27  64.52 
 
 
96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3157  50S ribosomal protein L27  64.52 
 
 
96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125079  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1651  ribosomal protein L27  67.47 
 
 
84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313884 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2540  50S ribosomal protein L27  64.52 
 
 
96 aa  114  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000133026  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  68.89 
 
 
92 aa  114  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4534  50S ribosomal protein L27  64.52 
 
 
96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000009897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4575  50S ribosomal protein L27  64.52 
 
 
96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000185796  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2259  ribosomal protein L27  67.06 
 
 
86 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.583782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4560  50S ribosomal protein L27  64.52 
 
 
96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0107  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  74.12 
 
 
85 aa  114  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11410  LSU ribosomal protein L27P  66.27 
 
 
85 aa  114  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.624774  hitchhiker  0.0010423 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  74.12 
 
 
85 aa  114  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4522  50S ribosomal protein L27  64.52 
 
 
96 aa  114  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.230769 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4340  50S ribosomal protein L27  64.52 
 
 
96 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4176  50S ribosomal protein L27  64.52 
 
 
96 aa  114  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4187  50S ribosomal protein L27  64.52 
 
 
96 aa  114  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200239  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4674  50S ribosomal protein L27  64.52 
 
 
96 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000903634  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 
93 aa  114  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0674  50S ribosomal protein L27  64.52 
 
 
96 aa  114  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611432  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4288  50S ribosomal protein L27  64.52 
 
 
96 aa  114  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000779074  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf327  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 
90 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.871003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1188  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
87 aa  113  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2282  ribosomal protein L27  66.27 
 
 
84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.277784  hitchhiker  0.000388636 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12468  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 
86 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.141175  normal  0.856367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12510  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 
85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.768162  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  68.6 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 
87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3554  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  68.6 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  68.6 
 
 
88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3549  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  68.6 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  73.26 
 
 
86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3622  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 
89 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
89 aa  111  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 
85 aa  111  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 
87 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
88 aa  111  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 
87 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1632  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 
87 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.848306  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  74.39 
 
 
85 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3314  50S ribosomal protein L27  65.91 
 
 
88 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000201837  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  74.39 
 
 
85 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  65.91 
 
 
89 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  61.86 
 
 
98 aa  110  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7271  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 
85 aa  110  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956462  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0461  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 
86 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297252 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  74.39 
 
 
85 aa  110  8.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 
86 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5479  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
84 aa  110  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0840601  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  70.24 
 
 
85 aa  110  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 
93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 
86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2636  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 
88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.288729  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>