39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1102 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1102  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
304 aa  627  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2895  transcriptional regulator, MarR family  51 
 
 
322 aa  332  4e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0512058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1222  transcriptional regulator, ArsR family  47.26 
 
 
300 aa  286  4e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20640  regulatory protein ArsR  43.56 
 
 
310 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2711  regulatory protein ArsR  42.41 
 
 
306 aa  263  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5706  hypothetical protein  40.48 
 
 
295 aa  247  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476701  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5584  transcriptional regulator, TrmB  40.34 
 
 
307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.107073 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5889  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
307 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6802  transcriptional regulator, ArsR family  39.66 
 
 
307 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  31.31 
 
 
104 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  47.17 
 
 
103 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  36.05 
 
 
120 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 
120 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11220  regulatory protein ArsR  33.72 
 
 
358 aa  47  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700894  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  36.51 
 
 
120 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 
106 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  42.31 
 
 
116 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2392  transcriptional regulator, ArsR family  39.34 
 
 
117 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  29.11 
 
 
211 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
106 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
106 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
106 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
106 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2080  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  36.84 
 
 
271 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
116 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  44.23 
 
 
119 aa  43.9  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  40.38 
 
 
114 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 
107 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  31.65 
 
 
106 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4522  ArsR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
103 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1231  transcriptional regulator, TrmB  40.32 
 
 
182 aa  43.1  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  35.85 
 
 
106 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  41.51 
 
 
324 aa  42.7  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  36.07 
 
 
112 aa  42.7  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2839  metal-regulated homodimeric transcriptional regulator  40.35 
 
 
93 aa  42.7  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
106 aa  42.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
104 aa  42.7  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2721  regulatory protein ArsR  33.72 
 
 
132 aa  42.7  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 
312 aa  42.4  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>