More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1071 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  100 
 
 
355 aa  721  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  64.39 
 
 
359 aa  483  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  67.51 
 
 
356 aa  472  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  63.2 
 
 
357 aa  467  1e-130  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  4.16881e-11  hitchhiker  3.05481e-10 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  60.56 
 
 
357 aa  460  1e-128  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  62.71 
 
 
367 aa  460  1e-128  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  60.73 
 
 
356 aa  459  1e-128  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  59.15 
 
 
360 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  7.99175e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  59.15 
 
 
360 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  3.28118e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  61.82 
 
 
360 aa  452  1e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  3.61971e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  60.45 
 
 
356 aa  454  1e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  59.04 
 
 
355 aa  441  1e-122  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  7.06535e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  60.8 
 
 
355 aa  440  1e-122  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.63816e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 
362 aa  439  1e-122  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  58.12 
 
 
356 aa  434  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  56.41 
 
 
355 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  1.00734e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  60.23 
 
 
355 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  7.29315e-09  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  56.13 
 
 
355 aa  429  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  4.88952e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  56.13 
 
 
358 aa  428  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  2.10571e-09  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  56.13 
 
 
358 aa  428  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.04378e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  56.13 
 
 
358 aa  428  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  1.38678e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  56.13 
 
 
358 aa  428  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  56.13 
 
 
358 aa  428  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  3.28302e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  56.41 
 
 
355 aa  430  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  1.28855e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  56.13 
 
 
358 aa  428  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.02063e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  58.76 
 
 
358 aa  431  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.77535e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  55.97 
 
 
355 aa  427  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  57.39 
 
 
355 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  55.84 
 
 
358 aa  426  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  5.02201e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  57.91 
 
 
358 aa  421  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  60.06 
 
 
360 aa  424  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  5.72262e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  56.82 
 
 
355 aa  422  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  58.47 
 
 
355 aa  422  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  5.09235e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  55.56 
 
 
355 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.69919e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  57.39 
 
 
356 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  59.77 
 
 
358 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.42042e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  56.53 
 
 
355 aa  423  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  57.91 
 
 
358 aa  421  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  54.96 
 
 
359 aa  419  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  57.18 
 
 
358 aa  420  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  60 
 
 
355 aa  420  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  56.09 
 
 
359 aa  418  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  56.25 
 
 
357 aa  416  1e-115  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0793  peptide chain release factor 1  56.37 
 
 
359 aa  417  1e-115  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.510985  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  56.53 
 
 
356 aa  414  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  9.63425e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  55.97 
 
 
359 aa  412  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  56.09 
 
 
356 aa  414  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.57905e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0610  peptide chain release factor 1  54.65 
 
 
357 aa  412  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0746132  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  62.82 
 
 
355 aa  414  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  3.18273e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  54.39 
 
 
360 aa  408  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  56.78 
 
 
358 aa  410  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.01474e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1784  peptide chain release factor 1  54.24 
 
 
356 aa  408  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  55.97 
 
 
359 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  54.78 
 
 
360 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0196  peptide chain release factor 1  54.26 
 
 
357 aa  405  1e-112  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.284546  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  55.06 
 
 
360 aa  405  1e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  53.39 
 
 
361 aa  405  1e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 
360 aa  405  1e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  54.21 
 
 
360 aa  406  1e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2449  peptide chain release factor 1  58.15 
 
 
359 aa  405  1e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 
363 aa  407  1e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3178  peptide chain release factor 1  56.7 
 
 
361 aa  402  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000107568  normal  0.412764 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  53.65 
 
 
360 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  54.9 
 
 
359 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 
362 aa  402  1e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  58.52 
 
 
357 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  53.65 
 
 
360 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  53.93 
 
 
360 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  54.65 
 
 
358 aa  399  1e-110  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  1.76457e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 
360 aa  399  1e-110  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  54.21 
 
 
360 aa  399  1e-110  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  52.25 
 
 
360 aa  399  1e-110  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 
360 aa  398  1e-110  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  54.34 
 
 
359 aa  401  1e-110  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 
360 aa  399  1e-110  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  53.93 
 
 
360 aa  399  1e-110  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  55.11 
 
 
354 aa  399  1e-110  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  54.83 
 
 
361 aa  399  1e-110  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  52.41 
 
 
363 aa  399  1e-110  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1036  peptide chain release factor 1  61.09 
 
 
357 aa  398  1e-110  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.125967  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3435  peptide chain release factor 1  58.36 
 
 
358 aa  398  1e-110  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 
360 aa  398  1e-110  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0074  peptide chain release factor 1  58.36 
 
 
355 aa  398  1e-110  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 
360 aa  398  1e-110  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  53.93 
 
 
360 aa  399  1e-110  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 
360 aa  399  1e-110  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  54.78 
 
 
360 aa  400  1e-110  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 
361 aa  399  1e-110  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.99484e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 
361 aa  399  1e-110  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  54.67 
 
 
355 aa  399  1e-110  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1869  peptide chain release factor 1  60.18 
 
 
359 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1800  peptide chain release factor 1  60.18 
 
 
377 aa  396  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 
360 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 
360 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 
360 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 
360 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  55.37 
 
 
360 aa  395  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 
363 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 
360 aa  394  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  54.39 
 
 
353 aa  397  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>