98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1058 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1058  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  291  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.131438  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0909  hypothetical protein  42.55 
 
 
200 aa  99.4  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000149992  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2186  hypothetical protein  39.69 
 
 
173 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1897  hypothetical protein  39.69 
 
 
173 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1562  hypothetical protein  41.48 
 
 
163 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.722772  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1843  hypothetical protein  39.86 
 
 
163 aa  94.7  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0266883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1521  hypothetical protein  39.72 
 
 
150 aa  91.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0233  hypothetical protein  38.58 
 
 
150 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0608  hypothetical protein  39.67 
 
 
150 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0622  hypothetical protein  39.67 
 
 
150 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0767  hypothetical protein  40.32 
 
 
152 aa  87.8  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247321  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  33.07 
 
 
164 aa  87  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  33.07 
 
 
164 aa  87  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0823  hypothetical protein  33.87 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0368548  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0302  hypothetical protein  31.62 
 
 
146 aa  84  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.216255  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  29.5 
 
 
164 aa  83.6  9e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0854  membrane spanning protein  37.38 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.607256 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1709  hypothetical protein  29.93 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000820605 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0555  hypothetical protein  32.09 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0711  hypothetical protein  30.07 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0549551  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1713  hypothetical protein  29.93 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0873  hypothetical protein  31.75 
 
 
156 aa  60.5  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0929072  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  32 
 
 
440 aa  59.3  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001669  hypothetical protein  34.38 
 
 
157 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.811357  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00804  hypothetical protein  35.42 
 
 
161 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  32.2 
 
 
410 aa  57.8  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0800  hypothetical protein  27.97 
 
 
154 aa  57.8  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0971  hypothetical protein  29.37 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.295057  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2923  hypothetical protein  31.75 
 
 
155 aa  56.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000118164  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3319  hypothetical protein  29.37 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.999931  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1040  hypothetical protein  29.37 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0218174  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3085  hypothetical protein  30.16 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1073  hypothetical protein  29.37 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0136401  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3647  hypothetical protein  29.37 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3215  hypothetical protein  29.37 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.488511  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3121  hypothetical protein  29.37 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0983  hypothetical protein  29.37 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348363  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0899  hypothetical protein  29.37 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0908411  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0907  conserved hypothetical protein-like protein  26.24 
 
 
193 aa  55.1  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497237  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0958  hypothetical protein  29.37 
 
 
155 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  29.51 
 
 
478 aa  53.5  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2825  hypothetical protein  28.12 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.538821 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1503  hypothetical protein  25.5 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0163258  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1008  hypothetical protein  28.57 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1291  hypothetical protein  24.19 
 
 
154 aa  51.6  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.762277  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1963  hypothetical protein  31.25 
 
 
167 aa  51.6  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0436579  hitchhiker  0.000913146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0856  hypothetical protein  26.19 
 
 
157 aa  51.2  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0598  hypothetical protein  29.25 
 
 
156 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.762355  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2857  hypothetical protein  33.04 
 
 
161 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00177194  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0558  hypothetical protein  27.73 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73355  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0365  membrane protein  31.25 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3450  hypothetical protein  27.18 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  24.37 
 
 
461 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3579  hypothetical protein  27.18 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0379  hypothetical protein  27.27 
 
 
177 aa  48.5  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  38.6 
 
 
406 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  36.84 
 
 
406 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  36.84 
 
 
406 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  36.84 
 
 
406 aa  47.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  36.84 
 
 
406 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  36.84 
 
 
406 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  36.84 
 
 
406 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  36.84 
 
 
406 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1617  hypothetical protein  26.79 
 
 
171 aa  47  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  36.84 
 
 
406 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0719  hypothetical protein  26.32 
 
 
156 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.334296 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3690  hypothetical protein  26.06 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.460322  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3837  hypothetical protein  28.42 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  36.84 
 
 
406 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1086  hypothetical protein  29.81 
 
 
174 aa  45.4  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.829899  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4900  hypothetical protein  28.72 
 
 
157 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4953  hypothetical protein  28.72 
 
 
157 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4799  hypothetical protein  28.72 
 
 
157 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal  0.570717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4866  hypothetical protein  28.72 
 
 
157 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4959  hypothetical protein  28.72 
 
 
157 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.375809  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  33.93 
 
 
406 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0372  protein of unknown function DUF1212  25.81 
 
 
464 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0521  hypothetical protein  26.6 
 
 
157 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650808 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0190  hypothetical protein  28.12 
 
 
159 aa  44.3  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  30 
 
 
406 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0779  hypothetical protein  26.21 
 
 
157 aa  43.9  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393956  normal  0.136083 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1299  hypothetical protein  28.12 
 
 
164 aa  43.9  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4908  hypothetical protein  27.66 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000105331  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4903  hypothetical protein  27.66 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105362  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3692  hypothetical protein  27.66 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000191847  hitchhiker  0.00156887 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4956  hypothetical protein  27.66 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000176607  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4595  hypothetical protein  27.66 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.2901e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1180  hypothetical protein  28.12 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  35.85 
 
 
406 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  34.12 
 
 
251 aa  42.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  33.96 
 
 
423 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3634  conserved hypothetical protein  27.66 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501605  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  32.73 
 
 
422 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  29.27 
 
 
426 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3642  hypothetical protein  28.16 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1825  hypothetical protein  29.76 
 
 
168 aa  40.8  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5876  hypothetical protein  27.66 
 
 
157 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000857143  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03184  hypothetical protein  23.39 
 
 
419 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>