More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1052 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 132 aa  263  5.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  57.66 
 
 		 123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  53.28 
 
 		 119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  50 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  53.21 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  51.35 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  50.45 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  50.45 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  50.45 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  47.27 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  50.91 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  48.18 
 
 		 116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  48.18 
 
 		 116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  49.55 
 
 		 118 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  49.55 
 
 		 118 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  48.25 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  48.65 
 
 		 118 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  48.65 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  48.65 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  48.65 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  48.65 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  47.75 
 
 		 118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  40.94 
 
 		 131 aa  107  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  44 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  46.72 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  41.96 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1247  ribosome-binding factor A  41.74 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0254008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1217  ribosome-binding factor A  41.74 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  39.84 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 		 119 aa  100  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  42.34 
 
 		 116 aa  98.6  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  44.35 
 
 		 130 aa  99.4  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  44.35 
 
 		 116 aa  99.4  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0822  ribosome-binding factor A  41.32 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  40.54 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  38.17 
 
 		 125 aa  97.8  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  39.67 
 
 		 132 aa  97.4  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1031  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 146 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.571877  hitchhiker  0.000026303 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  41.44 
 
 		 136 aa  97.1  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  38.6 
 
 		 118 aa  96.7  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  39.34 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  38.84 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1027  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106496 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1092  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0591977 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0991  ribosome-binding factor A  34.29 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1205  ribosome-binding factor A  38.05 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0962  ribosome-binding factor A  34.88 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.394859  normal  0.0786715 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  36.94 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  39.64 
 
 		 134 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2688  ribosome-binding factor A  38.79 
 
 		 123 aa  94.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2819  ribosome-binding factor A  38.79 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  42.34 
 
 		 119 aa  94  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  42.24 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  36.67 
 
 		 118 aa  92  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3642  ribosome-binding factor A  39.67 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0586  ribosome-binding factor A  36.64 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3474  ribosome-binding factor A  39.67 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0809  ribosome-binding factor A  37.4 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  38.98 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0901  hypothetical protein  42.98 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03034  ribosome-binding factor A  39.67 
 
 		 133 aa  92  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.710808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0538  ribosome-binding factor A  39.67 
 
 		 133 aa  92  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3463  ribosome-binding factor A  39.67 
 
 		 133 aa  92  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.287723 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4488  ribosome-binding factor A  39.67 
 
 		 133 aa  92  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2451  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0315755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3604  ribosome-binding factor A  39.67 
 
 		 133 aa  92  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3651  ribosome-binding factor A  39.67 
 
 		 133 aa  92  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02985  hypothetical protein  39.67 
 
 		 133 aa  92  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.757266  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3359  ribosome-binding factor A  39.67 
 
 		 133 aa  92  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0531  ribosome-binding factor A  39.67 
 
 		 133 aa  92  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  38.14 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0490  ribosome-binding factor A  37.04 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  40.77 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1008  ribosome-binding factor A  33.59 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211982  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0355  ribosome-binding factor A  38.74 
 
 		 137 aa  90.5  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.417644  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3543  ribosome-binding factor A  38.84 
 
 		 133 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3580  ribosome-binding factor A  38.84 
 
 		 133 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3595  ribosome-binding factor A  35.56 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000837981  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3464  ribosome-binding factor A  38.6 
 
 		 133 aa  88.6  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3474  ribosome-binding factor A  38.02 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  36.51 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3729  ribosome-binding factor A  35.56 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0092978  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  35.54 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  36.28 
 
 		 131 aa  88.6  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3994  ribosome-binding factor A  35.56 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.405974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3345  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.970615  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  37.84 
 
 		 147 aa  88.6  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  34.51 
 
 		 140 aa  88.2  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  35.45 
 
 		 130 aa  87.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  35.65 
 
 		 142 aa  87.4  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3604  ribosome-binding factor A  36.84 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0265365 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2204  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1696  ribosome-binding factor A  38.02 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03395  ribosome-binding factor A  34.35 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  34.55 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1028  ribosome-binding factor A  32.81 
 
 		 129 aa  84.3  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0189385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  30.63 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  30.25 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  31.54 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  30.63 
 
 		 132 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>