More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1031 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  100 
 
 
438 aa  906    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3163  histone deacetylase superfamily protein  55.13 
 
 
438 aa  534  1e-150  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114353  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0989  histone deacetylase superfamily protein  58.09 
 
 
437 aa  533  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0024  histone deacetylase superfamily  56.06 
 
 
439 aa  528  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0263374 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4058  histone deacetylase superfamily protein  54.46 
 
 
438 aa  526  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22480  histone deacetylase superfamily  55.38 
 
 
480 aa  508  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00877873  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2337  histone deacetylase family protein  52.4 
 
 
439 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0778  histone deacetylase superfamily  51.83 
 
 
435 aa  504  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1405  histone deacetylase superfamily protein  54.52 
 
 
478 aa  503  1e-141  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1093  histone deacetylase superfamily protein  52.31 
 
 
439 aa  498  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718834  normal  0.264484 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0976  hypothetical protein  53.52 
 
 
448 aa  501  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1885  histone deacetylase superfamily protein  53.58 
 
 
451 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2932  histone deacetylase  53.95 
 
 
528 aa  491  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00716511 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1009  Histone deacetylase  51.72 
 
 
450 aa  481  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.287637  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0223  Histone deacetylase  50.47 
 
 
446 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.195671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2127  Histone deacetylase  53.63 
 
 
447 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.003009  normal  0.054608 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0126  histone deacetylase superfamily  53.04 
 
 
473 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2733  histone deacetylase superfamily  45.9 
 
 
441 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  42.65 
 
 
364 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  41.84 
 
 
344 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  38.26 
 
 
343 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  39.6 
 
 
352 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  37.5 
 
 
345 aa  170  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  34.14 
 
 
322 aa  169  9e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  36.33 
 
 
308 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  33.72 
 
 
344 aa  168  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  43.46 
 
 
345 aa  167  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  34.29 
 
 
326 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  34.02 
 
 
334 aa  163  7e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  40.39 
 
 
309 aa  162  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  38.81 
 
 
311 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  39.19 
 
 
370 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  29.82 
 
 
331 aa  161  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  33.22 
 
 
316 aa  160  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  38.36 
 
 
311 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  35.92 
 
 
344 aa  160  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  34.12 
 
 
316 aa  159  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  32.38 
 
 
309 aa  159  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  40.53 
 
 
379 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  37 
 
 
365 aa  157  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1126  histone deacetylase superfamily protein  44.13 
 
 
336 aa  157  4e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.546018 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  36.32 
 
 
370 aa  157  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  33.03 
 
 
336 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  33.46 
 
 
417 aa  156  6e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  37.18 
 
 
369 aa  156  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  34.51 
 
 
309 aa  156  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  35.44 
 
 
309 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  32.56 
 
 
309 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  30.15 
 
 
403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  34.51 
 
 
309 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0991  Histone deacetylase  38.4 
 
 
327 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.964877  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  31.83 
 
 
337 aa  153  7e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  36.49 
 
 
369 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  34.33 
 
 
374 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  38.1 
 
 
346 aa  152  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  37.17 
 
 
369 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  43.62 
 
 
336 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  39.13 
 
 
309 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  36.73 
 
 
369 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  36.73 
 
 
369 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  31.18 
 
 
341 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  34.48 
 
 
380 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  31.83 
 
 
316 aa  150  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  40 
 
 
340 aa  150  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  33.22 
 
 
309 aa  150  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1746  histone deacetylase superfamily protein  33.57 
 
 
336 aa  150  5e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.115562 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  37.61 
 
 
399 aa  149  7e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  37.61 
 
 
399 aa  149  7e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  38.57 
 
 
309 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  31.82 
 
 
313 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  32.36 
 
 
379 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0478  histone deacetylase superfamily protein  40.66 
 
 
342 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  33.62 
 
 
380 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  37.02 
 
 
737 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  31.39 
 
 
407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  32.45 
 
 
309 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  38.35 
 
 
309 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  36.44 
 
 
369 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  37.6 
 
 
328 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  33.33 
 
 
309 aa  147  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  29.93 
 
 
390 aa  147  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  34.44 
 
 
396 aa  147  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  32.33 
 
 
323 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2111  histone deacetylase family protein  35.58 
 
 
340 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  37.25 
 
 
309 aa  146  8.000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  31.89 
 
 
328 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  30.98 
 
 
426 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  37.07 
 
 
311 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  37.75 
 
 
373 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  29.67 
 
 
309 aa  144  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  34.72 
 
 
335 aa  144  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  30.27 
 
 
325 aa  144  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  31.27 
 
 
370 aa  144  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3895  histone deacetylase superfamily protein  39.11 
 
 
341 aa  144  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  32.18 
 
 
306 aa  144  4e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2491  histone deacetylase family protein  34.72 
 
 
340 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2375  histone deacetylase family protein putative  34.72 
 
 
369 aa  143  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2035  histone deacetylase superfamily protein  39.6 
 
 
340 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12661  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  32.76 
 
 
348 aa  142  9e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  34.08 
 
 
371 aa  142  9e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>