172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0956 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  100 
 
 
743 aa  1479    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  39.7 
 
 
784 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  38.87 
 
 
778 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.26 
 
 
821 aa  397  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  39.09 
 
 
792 aa  396  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.44 
 
 
837 aa  393  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  39.14 
 
 
776 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  36.22 
 
 
2082 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.1 
 
 
818 aa  364  3e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  31.41 
 
 
911 aa  334  3e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  34.34 
 
 
717 aa  330  7e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  35.57 
 
 
714 aa  310  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  35.54 
 
 
1222 aa  291  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  29.93 
 
 
807 aa  261  4e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  39.53 
 
 
363 aa  250  8e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  39.24 
 
 
363 aa  249  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  38.68 
 
 
1129 aa  242  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  40.46 
 
 
469 aa  239  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  41.21 
 
 
1919 aa  233  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  39.1 
 
 
835 aa  231  5e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  39.14 
 
 
593 aa  225  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.82 
 
 
1679 aa  223  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  39.57 
 
 
726 aa  218  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  31.32 
 
 
921 aa  216  8e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  40.79 
 
 
389 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  40.76 
 
 
417 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  37.33 
 
 
681 aa  200  7.999999999999999e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  37.72 
 
 
477 aa  196  9e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  36.39 
 
 
551 aa  196  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  38.99 
 
 
1848 aa  194  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  38.04 
 
 
579 aa  193  9e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  30.85 
 
 
461 aa  192  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.72 
 
 
706 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.17 
 
 
1126 aa  188  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.25 
 
 
553 aa  187  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  32 
 
 
461 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  37.23 
 
 
558 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.36 
 
 
555 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.08 
 
 
561 aa  185  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.97 
 
 
556 aa  183  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  38.65 
 
 
569 aa  182  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  37.03 
 
 
546 aa  180  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.37 
 
 
554 aa  180  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.3 
 
 
555 aa  178  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  27.81 
 
 
1187 aa  177  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  37.02 
 
 
443 aa  177  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  35.71 
 
 
577 aa  177  8e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  33.02 
 
 
547 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.44 
 
 
570 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  41.35 
 
 
624 aa  173  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  36.24 
 
 
376 aa  173  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.02 
 
 
567 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  26.49 
 
 
1207 aa  172  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  28.36 
 
 
900 aa  172  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.46 
 
 
563 aa  171  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  32.94 
 
 
449 aa  171  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  35.97 
 
 
558 aa  171  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  36.47 
 
 
566 aa  168  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  35.87 
 
 
553 aa  167  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  35.95 
 
 
560 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  33.87 
 
 
597 aa  158  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  34.55 
 
 
737 aa  152  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  33.86 
 
 
554 aa  151  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  23.34 
 
 
728 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  32.14 
 
 
810 aa  137  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  31.88 
 
 
418 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  32.21 
 
 
403 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  30.47 
 
 
745 aa  135  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.91 
 
 
454 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  27.87 
 
 
558 aa  127  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1701  beta-lactamase inhibitory protein II  33.43 
 
 
298 aa  127  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  27.76 
 
 
396 aa  125  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  26.33 
 
 
575 aa  125  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  30.65 
 
 
328 aa  124  7e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  33.33 
 
 
618 aa  123  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  28.2 
 
 
341 aa  122  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.7 
 
 
787 aa  120  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.43 
 
 
692 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  27.19 
 
 
727 aa  119  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  28.44 
 
 
643 aa  119  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  31.55 
 
 
450 aa  119  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  30.67 
 
 
544 aa  118  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  35.34 
 
 
307 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  29.91 
 
 
638 aa  117  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1846  beta-lactamase inhibitory protein II  31.8 
 
 
295 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  27.2 
 
 
1312 aa  114  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19690  hypothetical protein  31.94 
 
 
285 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0713543  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  28.4 
 
 
499 aa  113  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.77 
 
 
941 aa  114  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.61 
 
 
817 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28035  predicted protein  27.94 
 
 
371 aa  114  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00114793  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3497  beta-lactamase inhibitory protein II  31.64 
 
 
295 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  30.15 
 
 
533 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  27.97 
 
 
447 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  28.72 
 
 
547 aa  108  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.96 
 
 
1147 aa  107  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36476  predicted protein  25.85 
 
 
520 aa  107  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  28.12 
 
 
390 aa  104  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  27.03 
 
 
643 aa  104  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  38.5 
 
 
375 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>