More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0940 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 327 aa  671    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  63.5 
 
 		 328 aa  447  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  63.8 
 
 		 354 aa  441  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  63.19 
 
 		 328 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  66.87 
 
 		 329 aa  430  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  61.42 
 
 		 328 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  59.33 
 
 		 328 aa  411  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  59.94 
 
 		 328 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  57.19 
 
 		 331 aa  410  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  63.41 
 
 		 328 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  55.62 
 
 		 331 aa  404  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  58.66 
 
 		 333 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  57.98 
 
 		 330 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  59.02 
 
 		 330 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  58.1 
 
 		 330 aa  395  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  58.1 
 
 		 330 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  58.41 
 
 		 330 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  58.41 
 
 		 330 aa  395  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  58.41 
 
 		 330 aa  395  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  58.41 
 
 		 330 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  58.41 
 
 		 330 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  56.57 
 
 		 330 aa  396  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  56.57 
 
 		 330 aa  392  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  58.72 
 
 		 329 aa  389  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  55.96 
 
 		 334 aa  390  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  55.08 
 
 		 328 aa  388  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  56.66 
 
 		 332 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  60.25 
 
 		 324 aa  374  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  54.13 
 
 		 332 aa  377  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  54.6 
 
 		 329 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  55.97 
 
 		 328 aa  369  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  54.91 
 
 		 333 aa  368  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  55.08 
 
 		 326 aa  369  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  53.21 
 
 		 330 aa  370  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  53.21 
 
 		 330 aa  370  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  54.69 
 
 		 332 aa  365  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  54.15 
 
 		 330 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  54.86 
 
 		 323 aa  365  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  54.21 
 
 		 332 aa  364  1e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  55.11 
 
 		 326 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  51.86 
 
 		 337 aa  354  8.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  53.8 
 
 		 332 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  51.99 
 
 		 326 aa  353  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  53.14 
 
 		 327 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  51.55 
 
 		 337 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  51.1 
 
 		 331 aa  348  7e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  50.91 
 
 		 328 aa  348  8e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  53.14 
 
 		 329 aa  347  2e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  50.3 
 
 		 329 aa  345  5e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  55.03 
 
 		 325 aa  343  2e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  51.56 
 
 		 332 aa  341  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  51.84 
 
 		 332 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  51.84 
 
 		 332 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  56.01 
 
 		 324 aa  338  5.9999999999999996e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  51.53 
 
 		 329 aa  338  7e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  53 
 
 		 321 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  48.93 
 
 		 330 aa  336  2.9999999999999997e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  51.68 
 
 		 331 aa  335  5e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  52.68 
 
 		 324 aa  334  1e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  48.78 
 
 		 327 aa  330  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  46.32 
 
 		 351 aa  330  2e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 320 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  52.05 
 
 		 327 aa  328  7e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  49.7 
 
 		 328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  48.31 
 
 		 333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  52.85 
 
 		 337 aa  321  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  48.98 
 
 		 356 aa  319  3e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  44.95 
 
 		 327 aa  317  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  45.73 
 
 		 328 aa  317  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  50.79 
 
 		 326 aa  316  3e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 		 320 aa  316  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  49.38 
 
 		 324 aa  316  4e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  44.92 
 
 		 334 aa  315  8e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  47.34 
 
 		 327 aa  314  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  50.32 
 
 		 330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  51.58 
 
 		 319 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  46.3 
 
 		 327 aa  311  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 		 327 aa  310  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  49.37 
 
 		 322 aa  309  4e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  51.42 
 
 		 318 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  48.77 
 
 		 326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  46.83 
 
 		 334 aa  306  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  47.78 
 
 		 350 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  50.95 
 
 		 316 aa  306  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1012  UDP-glucose 4-epimerase  47.63 
 
 		 327 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  48.15 
 
 		 328 aa  306  3e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 321 aa  306  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0255  UDP-glucose 4-epimerase  47.8 
 
 		 344 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  49.05 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  48.9 
 
 		 329 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  48.44 
 
 		 323 aa  303  2.0000000000000002e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  48.66 
 
 		 340 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  46.88 
 
 		 337 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0227  UDP-glucose 4-epimerase  46.86 
 
 		 344 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  48.1 
 
 		 353 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  47.04 
 
 		 338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  46.88 
 
 		 336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  47.04 
 
 		 338 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  50.16 
 
 		 335 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  47.92 
 
 		 337 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>