More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0872 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 420 aa  857    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  69.98 
 
 		 423 aa  616  1e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  70.17 
 
 		 424 aa  609  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  70.38 
 
 		 423 aa  600  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  63.74 
 
 		 424 aa  578  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  63.74 
 
 		 424 aa  578  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  63.74 
 
 		 424 aa  578  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  63.74 
 
 		 424 aa  578  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  63.74 
 
 		 424 aa  578  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  63.51 
 
 		 424 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  63.51 
 
 		 424 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  63.51 
 
 		 424 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 424 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  63.03 
 
 		 424 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  63.51 
 
 		 424 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  63.98 
 
 		 424 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  64.27 
 
 		 424 aa  570  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  65.71 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  65.32 
 
 		 421 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  64.99 
 
 		 425 aa  551  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  62.32 
 
 		 422 aa  552  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  63.64 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  62.5 
 
 		 423 aa  547  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  60.85 
 
 		 424 aa  545  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  63.07 
 
 		 427 aa  545  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  62.59 
 
 		 422 aa  544  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  61.63 
 
 		 422 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  61.65 
 
 		 425 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  61.63 
 
 		 422 aa  536  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  61.65 
 
 		 425 aa  537  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  61.24 
 
 		 423 aa  536  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  63.79 
 
 		 423 aa  534  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  61.39 
 
 		 423 aa  530  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  60.91 
 
 		 424 aa  528  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  60.19 
 
 		 422 aa  525  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  59.23 
 
 		 425 aa  518  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  58.65 
 
 		 423 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  60.67 
 
 		 422 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  60.05 
 
 		 425 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  58.65 
 
 		 422 aa  512  1e-144  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  59.71 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  57.21 
 
 		 427 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  58.53 
 
 		 422 aa  505  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  58.27 
 
 		 425 aa  501  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  57.35 
 
 		 424 aa  504  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  57.88 
 
 		 432 aa  504  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  56.59 
 
 		 427 aa  501  1e-141  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  56.74 
 
 		 424 aa  500  1e-140  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  58.27 
 
 		 427 aa  500  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  57.18 
 
 		 425 aa  499  1e-140  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  56.22 
 
 		 426 aa  496  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  58.17 
 
 		 423 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  59.95 
 
 		 423 aa  492  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  58.02 
 
 		 426 aa  493  9.999999999999999e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  56.13 
 
 		 430 aa  493  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  56.13 
 
 		 425 aa  490  1e-137  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  56.12 
 
 		 426 aa  491  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  55.66 
 
 		 423 aa  489  1e-137  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  54.89 
 
 		 428 aa  481  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  56.78 
 
 		 430 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  58.02 
 
 		 425 aa  481  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  54.09 
 
 		 435 aa  473  1e-132  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  53.83 
 
 		 428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  53.7 
 
 		 427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  53.83 
 
 		 428 aa  467  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  58.02 
 
 		 425 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  54.05 
 
 		 427 aa  466  9.999999999999999e-131  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  53.83 
 
 		 428 aa  467  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  54.5 
 
 		 428 aa  463  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 421 aa  464  1e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1724  seryl-tRNA synthetase  55.27 
 
 		 426 aa  463  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 429 aa  461  9.999999999999999e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  52.51 
 
 		 427 aa  460  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0825  seryl-tRNA synthetase  53.76 
 
 		 427 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.771006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 434 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3916  seryl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 435 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.599878  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3853  seryl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 435 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0695  seryl-tRNA synthetase  51.05 
 
 		 435 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  53.79 
 
 		 427 aa  456  1e-127  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3994  seryl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0575  seryl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 426 aa  452  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4645  seryl-tRNA synthetase  54.46 
 
 		 424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000263094  normal  0.52654 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  53.74 
 
 		 427 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  53.22 
 
 		 424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  53.41 
 
 		 435 aa  451  1.0000000000000001e-126  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  53.32 
 
 		 428 aa  450  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  52.84 
 
 		 428 aa  451  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  52.84 
 
 		 428 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000518192  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0551  seryl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 426 aa  451  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  51.44 
 
 		 421 aa  449  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1823  seryl-tRNA synthetase  53.4 
 
 		 427 aa  449  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  51.44 
 
 		 421 aa  449  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 428 aa  449  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 433 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  52.61 
 
 		 428 aa  450  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>