More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0708 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  100 
 
 
438 aa  858    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  53.04 
 
 
428 aa  432  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  50.81 
 
 
432 aa  409  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  47.78 
 
 
428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  50.93 
 
 
428 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  52.09 
 
 
428 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  48.59 
 
 
428 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  45.9 
 
 
427 aa  350  3e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  42.25 
 
 
435 aa  349  6e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  43.19 
 
 
426 aa  348  8e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  43.06 
 
 
429 aa  344  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  42.39 
 
 
438 aa  341  2e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  43.92 
 
 
446 aa  339  5e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  41.9 
 
 
433 aa  339  5.9999999999999996e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  42.09 
 
 
435 aa  339  5.9999999999999996e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  44.84 
 
 
425 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  44.6 
 
 
425 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  44.6 
 
 
425 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  44.6 
 
 
425 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  44.6 
 
 
425 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  44.6 
 
 
425 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  44.6 
 
 
425 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  42.82 
 
 
433 aa  336  5.999999999999999e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  42.82 
 
 
433 aa  336  5.999999999999999e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  44.37 
 
 
425 aa  333  4e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  44.37 
 
 
425 aa  333  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  43.43 
 
 
425 aa  331  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  41.69 
 
 
446 aa  328  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  41.03 
 
 
435 aa  326  5e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  39.04 
 
 
436 aa  323  3e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  39.03 
 
 
438 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  38.93 
 
 
427 aa  311  1e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  45.38 
 
 
428 aa  309  5.9999999999999995e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  45.38 
 
 
428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  39.03 
 
 
449 aa  303  6.000000000000001e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  39.67 
 
 
451 aa  296  5e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  39.48 
 
 
431 aa  293  4e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  37.06 
 
 
427 aa  292  1e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  37.76 
 
 
427 aa  280  4e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  33.65 
 
 
488 aa  277  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  34.75 
 
 
439 aa  269  8e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  35.25 
 
 
433 aa  266  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  39.49 
 
 
433 aa  265  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  40.26 
 
 
439 aa  258  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  34.95 
 
 
433 aa  256  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  35.63 
 
 
435 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  38.06 
 
 
424 aa  252  1e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  36.43 
 
 
431 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  34.25 
 
 
435 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  34.79 
 
 
481 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  31.48 
 
 
483 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  37.95 
 
 
430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  37.35 
 
 
478 aa  243  5e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  33.49 
 
 
442 aa  236  5.0000000000000005e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  32.65 
 
 
437 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  30.75 
 
 
507 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  33.1 
 
 
481 aa  233  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  33.33 
 
 
463 aa  233  6e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  32.48 
 
 
461 aa  222  8e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  29.23 
 
 
443 aa  222  9e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  32.56 
 
 
448 aa  222  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  33.17 
 
 
435 aa  219  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  30.65 
 
 
468 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3590  trigger factor  33.67 
 
 
452 aa  216  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0497135  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  31.46 
 
 
482 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  30.95 
 
 
479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  31.46 
 
 
478 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  31.46 
 
 
478 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  32.35 
 
 
440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  31.71 
 
 
429 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  31.71 
 
 
429 aa  212  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  32.18 
 
 
466 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  33.6 
 
 
447 aa  210  4e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  33.03 
 
 
500 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  32.89 
 
 
447 aa  209  7e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  30.27 
 
 
454 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  31.02 
 
 
429 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  31.25 
 
 
430 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  31.15 
 
 
471 aa  206  6e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1894  trigger factor  32.7 
 
 
432 aa  205  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  33.16 
 
 
437 aa  205  1e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  32.9 
 
 
437 aa  205  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  30.73 
 
 
463 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  31.21 
 
 
471 aa  204  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  33.16 
 
 
436 aa  203  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  32.01 
 
 
448 aa  202  7e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  31.25 
 
 
500 aa  202  9e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  29.03 
 
 
434 aa  202  9e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2524  trigger factor  29.82 
 
 
474 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  29.67 
 
 
473 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  28.64 
 
 
433 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl405  trigger factor, prolyl isomerase  31.25 
 
 
426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  29.02 
 
 
448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  31.35 
 
 
458 aa  199  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0198  trigger factor  29.95 
 
 
435 aa  199  7e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  31.12 
 
 
512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  30.81 
 
 
448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  30.07 
 
 
438 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7404  trigger factor  32.77 
 
 
473 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  27.09 
 
 
449 aa  197  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>