More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0658 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 162 aa  321  3e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  63.58 
 
 		 157 aa  179  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  57.59 
 
 		 158 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  57.59 
 
 		 158 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  60.26 
 
 		 159 aa  179  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  57.62 
 
 		 161 aa  177  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  56.33 
 
 		 158 aa  164  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  57.62 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  50.99 
 
 		 163 aa  162  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  53.64 
 
 		 160 aa  157  8e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  57.25 
 
 		 158 aa  154  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  52.32 
 
 		 160 aa  154  4e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  57.25 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  52.63 
 
 		 158 aa  153  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  54.07 
 
 		 159 aa  154  7e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  51.32 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  51.9 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  51.9 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 158 aa  147  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 158 aa  147  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 175 aa  147  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  53.69 
 
 		 156 aa  147  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 158 aa  147  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 		 175 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  48.34 
 
 		 156 aa  144  7.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  51.75 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  55.7 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  47.02 
 
 		 159 aa  140  9e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  50.99 
 
 		 160 aa  140  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0116  transcription elongation factor GreA  58 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000184686  hitchhiker  0.00194606 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  49.01 
 
 		 159 aa  138  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  48.68 
 
 		 156 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  52.14 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  51.33 
 
 		 159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 		 157 aa  133  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  50.33 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  49.66 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 176 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 160 aa  130  6.999999999999999e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 154 aa  130  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  48.32 
 
 		 157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1612  transcription elongation factor GreA  51.13 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.986319  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  48.67 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  49.33 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3557  transcription elongation factor GreA  48.73 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000103558  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  48.34 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  46.43 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1174  transcription elongation factor GreA  52.94 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 160 aa  121  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  43.14 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1667  transcription elongation factor GreA  50.98 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1701  transcription elongation factor GreA  50.98 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0304  transcription elongation factor GreA  44.59 
 
 		 157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0669  transcription elongation factor GreA  41.33 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 157 aa  117  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  43.92 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1188  transcription elongation factor GreA  43.75 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00439545  normal  0.0602948 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  41.61 
 
 		 164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  43.14 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  42.31 
 
 		 161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  43.33 
 
 		 152 aa  114  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0383  transcription elongation factor GreA  40.67 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0620714 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2238  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0176047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  41.03 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  41.61 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf206  transcription elongation factor  39.22 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0144  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  39.33 
 
 		 158 aa  111  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4207  transcription elongation factor GreA  38.82 
 
 		 169 aa  111  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  43.92 
 
 		 156 aa  110  6e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0780  GreA/GreB family elongation factor  44.6 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000129967  hitchhiker  0.000100122 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  43.36 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  41.77 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1044  transcription elongation factor GreA  40.67 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000369398  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  42.14 
 
 		 168 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  40.94 
 
 		 157 aa  107  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  39.87 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  40.26 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1629  transcription elongation factor GreA  37.91 
 
 		 162 aa  107  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl102  transcription elongation factor GreA  45.19 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>