More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0625 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 415 aa  819    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  50.36 
 
 		 411 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000572302  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  44.42 
 
 		 411 aa  348  1e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  47.06 
 
 		 416 aa  345  8e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  44.39 
 
 		 461 aa  335  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  45.6 
 
 		 413 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  44.81 
 
 		 735 aa  326  6e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  41.5 
 
 		 419 aa  324  1e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  41.5 
 
 		 419 aa  325  1e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  46.59 
 
 		 399 aa  322  8e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0536  protein-export membrane protein SecD  41.34 
 
 		 441 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000245038  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  41.87 
 
 		 403 aa  303  5.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  40.73 
 
 		 410 aa  295  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  40 
 
 		 445 aa  287  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000019832  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  42.74 
 
 		 403 aa  285  7e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0716  SecD/SecF family protein-export membrane protein  39.9 
 
 		 734 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  40.58 
 
 		 406 aa  278  9e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  39.95 
 
 		 464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1285  protein-export membrane protein SecD  39.44 
 
 		 423 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0952765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  38.19 
 
 		 461 aa  271  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  36.2 
 
 		 470 aa  257  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  37.79 
 
 		 525 aa  257  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0313  preprotein translocase subunit SecD  41.58 
 
 		 449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119854  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  37.23 
 
 		 532 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_275  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecD subunit  41.34 
 
 		 449 aa  253  5.000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000478055  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  40.22 
 
 		 530 aa  252  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  36.51 
 
 		 534 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  36.97 
 
 		 533 aa  251  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.28 
 
 		 856 aa  251  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  36.91 
 
 		 533 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  49.81 
 
 		 471 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  35.94 
 
 		 740 aa  249  5e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  39.73 
 
 		 531 aa  249  8e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0333  preprotein translocase subunit SecD  41.48 
 
 		 449 aa  248  1e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000488895  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  35.75 
 
 		 533 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  37.44 
 
 		 474 aa  248  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  38.42 
 
 		 594 aa  247  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  38.42 
 
 		 594 aa  247  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  39.57 
 
 		 533 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  43.83 
 
 		 470 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  43.83 
 
 		 470 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  35.26 
 
 		 533 aa  243  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  39.12 
 
 		 533 aa  243  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  34.88 
 
 		 531 aa  242  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  36.53 
 
 		 533 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.08 
 
 		 856 aa  239  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  39.57 
 
 		 512 aa  239  8e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  35.92 
 
 		 533 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  34.93 
 
 		 534 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  34.37 
 
 		 472 aa  237  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  39.84 
 
 		 524 aa  237  3e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  36.24 
 
 		 532 aa  237  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  33.88 
 
 		 534 aa  237  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  39.21 
 
 		 533 aa  236  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  35.05 
 
 		 554 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  34.71 
 
 		 532 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2102  protein-export membrane protein SecD  35.5 
 
 		 433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.459213  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  35.05 
 
 		 554 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  34.71 
 
 		 532 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.69 
 
 		 853 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  34.17 
 
 		 534 aa  234  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0504  protein-export membrane protein SecD  34.55 
 
 		 462 aa  234  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000522922  hitchhiker  0.000170526 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  36.61 
 
 		 554 aa  233  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  36.29 
 
 		 535 aa  233  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  35.92 
 
 		 464 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  36.6 
 
 		 533 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  35.29 
 
 		 532 aa  232  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.65 
 
 		 848 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  35.29 
 
 		 530 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  45.07 
 
 		 515 aa  231  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  36.12 
 
 		 468 aa  230  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  39.39 
 
 		 526 aa  231  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  35.09 
 
 		 554 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  36.8 
 
 		 761 aa  230  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.93 
 
 		 849 aa  230  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.43 
 
 		 750 aa  229  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  36.24 
 
 		 556 aa  229  5e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  35.23 
 
 		 533 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  35.85 
 
 		 532 aa  227  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  38.13 
 
 		 532 aa  226  4e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  39.81 
 
 		 457 aa  226  7e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0883  preprotein translocase subunit SecD  38.46 
 
 		 508 aa  225  1e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  34.87 
 
 		 532 aa  225  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  36.69 
 
 		 554 aa  225  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  37.53 
 
 		 748 aa  225  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  33.85 
 
 		 554 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1905  protein-export membrane protein SecD  34.15 
 
 		 477 aa  223  4e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  34.76 
 
 		 759 aa  223  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0627  protein-export membrane protein SecD  39.03 
 
 		 502 aa  222  7e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.57035  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  34.34 
 
 		 843 aa  222  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.62 
 
 		 750 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  36.34 
 
 		 501 aa  220  3e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  33.86 
 
 		 474 aa  220  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  35.71 
 
 		 531 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 535 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1106  preprotein translocase subunit SecD  38.74 
 
 		 505 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  43.46 
 
 		 489 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  45.39 
 
 		 495 aa  219  5e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  46.15 
 
 		 595 aa  219  6e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  32.88 
 
 		 487 aa  219  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>