More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0614 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
435 aa  889    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  52.36 
 
 
420 aa  453  1.0000000000000001e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  50.75 
 
 
451 aa  423  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  47.14 
 
 
422 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  43.61 
 
 
431 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  41.57 
 
 
444 aa  347  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  40.29 
 
 
495 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  34.35 
 
 
434 aa  243  6e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  36.11 
 
 
427 aa  241  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  34.2 
 
 
442 aa  228  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  32.49 
 
 
441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  32.98 
 
 
448 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  33.78 
 
 
441 aa  219  5e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  34.22 
 
 
442 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.08 
 
 
435 aa  207  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  28.5 
 
 
424 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  32.78 
 
 
431 aa  189  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  31.27 
 
 
441 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  28.6 
 
 
428 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  30.52 
 
 
435 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.67 
 
 
438 aa  178  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  30.75 
 
 
419 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  29.95 
 
 
441 aa  169  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 
435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 
435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 
434 aa  163  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 
431 aa  158  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.84 
 
 
427 aa  159  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  29.18 
 
 
434 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  29.47 
 
 
424 aa  157  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 
433 aa  155  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 
441 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  26.72 
 
 
429 aa  154  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  28.43 
 
 
434 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 
427 aa  152  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  29.76 
 
 
432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.42 
 
 
428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0185  extracellular solute-binding protein family 1  29.31 
 
 
436 aa  139  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.515223  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  27.73 
 
 
424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2754  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 
443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 
439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.86 
 
 
426 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 
470 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 
451 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  24.86 
 
 
437 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  28.18 
 
 
417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 
455 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  30.77 
 
 
446 aa  111  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 
468 aa  110  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.02 
 
 
436 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 
408 aa  107  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2115  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 
432 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.845793  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 
423 aa  101  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  26.21 
 
 
413 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  27.18 
 
 
399 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  25 
 
 
410 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.14 
 
 
380 aa  99.8  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 
434 aa  98.6  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  23.04 
 
 
439 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  28.29 
 
 
431 aa  94.4  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.35 
 
 
441 aa  93.2  8e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 
422 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5441  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 
452 aa  90.5  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 
408 aa  90.5  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 
434 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 
455 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 
419 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 
420 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 
420 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 
419 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4751  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 
417 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.378465 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 
493 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 
419 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 
419 aa  87.4  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 
435 aa  87  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 
451 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4662  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 
417 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.917353 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 
457 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
408 aa  84.7  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 
421 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1963  extracellular solute-binding protein family 1  23.78 
 
 
449 aa  83.2  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.734467  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 
432 aa  82  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  21.51 
 
 
427 aa  82.4  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  20.6 
 
 
414 aa  82.4  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0374  extracellular solute-binding protein family 1  22.52 
 
 
458 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0240532 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  20.57 
 
 
417 aa  80.9  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 
452 aa  79.7  0.00000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0059  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 
439 aa  79.7  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 
417 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  28.78 
 
 
414 aa  79  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 
440 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  28.92 
 
 
454 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  26.15 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  26.15 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  22.33 
 
 
412 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  22.33 
 
 
412 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  22.36 
 
 
444 aa  77.4  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 
444 aa  76.3  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>