25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0587 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0587  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0873705  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0807  hypothetical protein  57.33 
 
 
302 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00370253  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00720  hypothetical protein  50.33 
 
 
305 aa  317  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000877673  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0112  hypothetical protein  48.15 
 
 
304 aa  312  4.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000282861  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2695  hypothetical protein  46.67 
 
 
317 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0149  hypothetical protein  48.16 
 
 
300 aa  295  5e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0567257  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0475  hypothetical protein  45.36 
 
 
299 aa  286  4e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3630  dehydrogenase-like protein  45.87 
 
 
312 aa  286  4e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.496684  normal  0.352042 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1511  hypothetical protein  44.44 
 
 
301 aa  283  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.850305  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0114  hypothetical protein  46.82 
 
 
302 aa  283  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0358289  hitchhiker  0.00078389 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2025  hypothetical protein  45.51 
 
 
299 aa  278  9e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0375526  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1830  hypothetical protein  44 
 
 
304 aa  260  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.290615 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0492  hypothetical protein  39.93 
 
 
334 aa  241  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1617  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.57 
 
 
685 aa  185  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1330  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.57 
 
 
685 aa  185  8e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.372745  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4364  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  29.47 
 
 
691 aa  163  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103685  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0662  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.93 
 
 
681 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0104064  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1644  dehydrogenase-like protein  25.49 
 
 
707 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2305  dehydrogenase-like  25.16 
 
 
720 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1566  dehydrogenase-like protein  24.51 
 
 
707 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1059  dehydrogenase-like  24.51 
 
 
684 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1964  putative dehydrogenase  20.83 
 
 
710 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2362  dehydrogenase-like protein  26.06 
 
 
728 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.221453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2483  dehydrogenase-like protein  24.64 
 
 
728 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0417165  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1668  putative dehydrogenase  21.57 
 
 
689 aa  86.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0410472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>