More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0581 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  100 
 
 
331 aa  669    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  36.91 
 
 
163 aa  102  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  37.88 
 
 
164 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  32.69 
 
 
159 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.01 
 
 
159 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  34.01 
 
 
159 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  34.01 
 
 
159 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  34.01 
 
 
159 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  34.69 
 
 
161 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
671 aa  94  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  34.01 
 
 
159 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  34.01 
 
 
159 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  33.11 
 
 
159 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 
1031 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  35.61 
 
 
164 aa  93.2  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  35.25 
 
 
163 aa  93.2  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 
164 aa  92  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  34.85 
 
 
164 aa  92.4  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  34.85 
 
 
164 aa  92  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  34.53 
 
 
159 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3199  chemotaxis protein CheA  31.9 
 
 
561 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.09 
 
 
174 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  33.33 
 
 
162 aa  91.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  42.31 
 
 
1089 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
1030 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 
954 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 
687 aa  90.9  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
652 aa  90.9  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.81 
 
 
164 aa  90.5  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  33.81 
 
 
164 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  33.81 
 
 
164 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  33.81 
 
 
164 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  35.61 
 
 
159 aa  90.5  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  34.04 
 
 
161 aa  89.7  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.81 
 
 
164 aa  89.4  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 
671 aa  89.4  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  33.81 
 
 
164 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  35.61 
 
 
161 aa  88.6  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  33.81 
 
 
164 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  33.81 
 
 
164 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  33.81 
 
 
164 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  34.85 
 
 
164 aa  88.2  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 
681 aa  88.2  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  33.81 
 
 
164 aa  88.6  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
675 aa  87  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  33.81 
 
 
164 aa  87.4  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  33.81 
 
 
163 aa  87.4  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  36.36 
 
 
164 aa  87.4  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
655 aa  87  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 
607 aa  86.7  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 
598 aa  86.3  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
603 aa  86.3  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
604 aa  85.9  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
732 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  33.33 
 
 
162 aa  85.5  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 
741 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  34.58 
 
 
610 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 
666 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  30.85 
 
 
767 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
696 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1599  CheA signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
722 aa  82.8  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  31.16 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  32.52 
 
 
910 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  32.19 
 
 
165 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  33.87 
 
 
760 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  33.87 
 
 
762 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 
606 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  33.87 
 
 
762 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  31.94 
 
 
183 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  34.17 
 
 
714 aa  80.5  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  30.3 
 
 
785 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
871 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0433  CheA signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
730 aa  80.5  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.645464  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
747 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
709 aa  80.5  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  32.5 
 
 
754 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
747 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3205  CheW protein  31.25 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200572  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  36.19 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 
650 aa  79.3  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  29.93 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2099  CheW protein  35.34 
 
 
139 aa  79  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  32.35 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
741 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  29.6 
 
 
783 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
1063 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
746 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
738 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  37.1 
 
 
1104 aa  78.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  33.33 
 
 
601 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1730  CheW protein  28.03 
 
 
203 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  26.79 
 
 
769 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
759 aa  79  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4378  CheA signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 
725 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  35.25 
 
 
692 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  26.79 
 
 
769 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2144  chemotaxis protein cheW  32.61 
 
 
175 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  38.78 
 
 
729 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  39.42 
 
 
733 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
733 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>