More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0572 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  64.82 
 
 		 572 aa  743    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 570 aa  659    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 572 aa  1175    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 		 573 aa  638    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  55.08 
 
 		 585 aa  652    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  55.04 
 
 		 570 aa  647    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 573 aa  651    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  55.2 
 
 		 574 aa  652    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  53.6 
 
 		 573 aa  639    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  56.94 
 
 		 570 aa  665    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 		 570 aa  663    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  54.72 
 
 		 570 aa  649    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  65.67 
 
 		 570 aa  766    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  53.44 
 
 		 569 aa  647    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 		 580 aa  622  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 567 aa  622  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 		 567 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  52.31 
 
 		 574 aa  619  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 		 566 aa  618  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 		 566 aa  616  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 		 575 aa  618  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  51.38 
 
 		 579 aa  617  1e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  51.04 
 
 		 576 aa  616  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 566 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 		 566 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 566 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 566 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 		 566 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 		 566 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 566 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 		 566 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 		 576 aa  608  1e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 		 574 aa  610  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 566 aa  610  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 		 564 aa  608  1e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 566 aa  609  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  53.02 
 
 		 574 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  52.64 
 
 		 571 aa  606  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 		 572 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 		 568 aa  605  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 		 571 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 		 584 aa  604  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 		 577 aa  600  1e-170  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 577 aa  600  1e-170  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 		 575 aa  597  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1323  prolyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 567 aa  580  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1349  prolyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 567 aa  580  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 574 aa  578  1.0000000000000001e-163  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0104  prolyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 		 578 aa  575  1.0000000000000001e-163  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 		 570 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 		 570 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 		 564 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2220  prolyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 595 aa  569  1e-161  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 573 aa  571  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  49.31 
 
 		 576 aa  570  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1242  prolyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 		 582 aa  566  1e-160  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0830  prolyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 567 aa  564  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0265646  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0686  prolyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 		 565 aa  561  1e-158  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.690918  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 		 569 aa  561  1e-158  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0368  prolyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 569 aa  556  1e-157  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.014128  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0909  Pectate lyase/Amb allergen  49.22 
 
 		 575 aa  557  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000725309  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 		 570 aa  558  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0684  prolyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 573 aa  553  1e-156  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975412  hitchhiker  0.000000000000032501 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 577 aa  553  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_312  prolyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 569 aa  548  1e-155  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 569 aa  551  1e-155  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 		 569 aa  550  1e-155  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 568 aa  550  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2112  prolyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 		 579 aa  544  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0693  prolyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 		 577 aa  544  1e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0657028  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0350  prolyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 569 aa  538  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.918323  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0400  prolyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 571 aa  541  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0189539  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0748  prolyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 572 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00105026  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03253  prolyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 571 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 571 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2498  prolyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 590 aa  538  9.999999999999999e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.83332  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 571 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 578 aa  536  1e-151  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0873  prolyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 572 aa  537  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.922522  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1063  prolyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 587 aa  537  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.408216  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0325  prolyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 574 aa  538  1e-151  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0218  prolyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 580 aa  535  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.230302 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3347  prolyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 572 aa  533  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0134098  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 572 aa  531  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 573 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 		 574 aa  533  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 		 571 aa  535  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  48.38 
 
 		 573 aa  534  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0892  prolyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 		 571 aa  534  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32096  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0688  prolyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 572 aa  533  1e-150  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 580 aa  533  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 572 aa  535  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 571 aa  534  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 569 aa  528  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1075  prolyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 572 aa  528  1e-149  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1959  prolyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 600 aa  531  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 		 571 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0420  prolyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 573 aa  529  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 578 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 		 571 aa  530  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>