More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0455 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  100 
 
 
451 aa  921    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  54.34 
 
 
448 aa  503  1e-141  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  46.58 
 
 
453 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  44.99 
 
 
458 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  44.67 
 
 
460 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  44.99 
 
 
458 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  44.77 
 
 
458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  44.77 
 
 
458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  44.77 
 
 
458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  44.77 
 
 
458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  47.09 
 
 
459 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  44.77 
 
 
458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  44.99 
 
 
458 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  45.96 
 
 
457 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  44.54 
 
 
454 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  44.54 
 
 
454 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  46.17 
 
 
460 aa  398  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  46.67 
 
 
454 aa  393  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  44.96 
 
 
455 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  44.52 
 
 
455 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  41.97 
 
 
453 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  41.97 
 
 
453 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  41.29 
 
 
456 aa  367  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  42.69 
 
 
453 aa  363  5.0000000000000005e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  39.19 
 
 
457 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  38.22 
 
 
468 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  37.95 
 
 
460 aa  332  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  37.02 
 
 
459 aa  324  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  37.02 
 
 
459 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  37.02 
 
 
459 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  37.02 
 
 
459 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  39.64 
 
 
458 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  37.02 
 
 
459 aa  324  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  37.02 
 
 
459 aa  324  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  36.91 
 
 
459 aa  323  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  37.02 
 
 
459 aa  324  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  37.02 
 
 
459 aa  324  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  37.92 
 
 
453 aa  323  4e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  36.7 
 
 
459 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  36.89 
 
 
467 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  35.94 
 
 
458 aa  318  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  36.73 
 
 
451 aa  316  5e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  38.08 
 
 
450 aa  314  1.9999999999999998e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  38 
 
 
459 aa  313  3.9999999999999997e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  37.56 
 
 
436 aa  310  4e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  35.63 
 
 
455 aa  302  7.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1577  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  34.44 
 
 
464 aa  300  4e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  35.21 
 
 
471 aa  297  3e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  36.3 
 
 
454 aa  295  8e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  34.84 
 
 
457 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  35.98 
 
 
465 aa  293  5e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  34.93 
 
 
460 aa  292  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  36.3 
 
 
456 aa  291  2e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  38.78 
 
 
447 aa  290  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  37.69 
 
 
572 aa  287  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1674  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  35.94 
 
 
458 aa  285  1.0000000000000001e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  34.92 
 
 
455 aa  283  4.0000000000000003e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  34.76 
 
 
460 aa  282  7.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  35.73 
 
 
493 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  34.2 
 
 
457 aa  281  2e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  34.08 
 
 
461 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  34.08 
 
 
461 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  34.5 
 
 
489 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0147  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  34.51 
 
 
496 aa  278  1e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.689993  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  32.7 
 
 
473 aa  277  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  33.76 
 
 
485 aa  278  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0423  tRNA methyltransferase, TrmA family  34.86 
 
 
439 aa  277  2e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  34.89 
 
 
470 aa  276  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  33.55 
 
 
451 aa  273  5.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0451  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  34.67 
 
 
463 aa  271  2e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.450901  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  35.29 
 
 
495 aa  270  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1868  RNA methyltransferase, TrmA family  34.39 
 
 
485 aa  268  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  33.19 
 
 
488 aa  266  5e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0413  RNA methyltransferase  33.41 
 
 
451 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0690  RNA methyltransferase, TrmA family  30.02 
 
 
449 aa  262  8.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  33.86 
 
 
419 aa  259  6e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  30.75 
 
 
488 aa  253  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  32.18 
 
 
477 aa  253  7e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  33.94 
 
 
446 aa  250  3e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05160  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  35.66 
 
 
401 aa  250  4e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.368035  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  32.09 
 
 
479 aa  249  5e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2518  RNA methyltransferase, TrmA family  32.96 
 
 
482 aa  249  5e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.391256  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2737  RNA methyltransferase  30.82 
 
 
476 aa  250  5e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  30.9 
 
 
466 aa  249  6e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2903  RNA methyltransferase, TrmA family  33.66 
 
 
438 aa  248  1e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  33.11 
 
 
481 aa  248  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2309  RNA methyltransferase  32.21 
 
 
493 aa  247  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.12141  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1583  RNA methyltransferase, TrmA family  34 
 
 
446 aa  247  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000730131  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1654  RNA methyltransferase  34.22 
 
 
554 aa  246  8e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000278759  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  31.34 
 
 
470 aa  243  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1235  RNA methyltransferase, TrmA family  31.67 
 
 
462 aa  244  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  31.61 
 
 
478 aa  243  5e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  27.86 
 
 
479 aa  242  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0005  TrmA family RNA methyltransferase  33.93 
 
 
468 aa  241  2e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2487  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  33.12 
 
 
513 aa  241  2e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0134453  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0053  RNA methyltransferase, TrmA family  33.9 
 
 
415 aa  241  2.9999999999999997e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  34.23 
 
 
439 aa  239  9e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1688  RNA methyltransferase, TrmA family  32.47 
 
 
476 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  32.3 
 
 
470 aa  238  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  34.38 
 
 
439 aa  237  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>