231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0328 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0252  secretion protein HlyD family protein  95.06 
 
 
466 aa  837    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0254849  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0328  hypothetical protein  100 
 
 
466 aa  906    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00489922  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1083  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  27.61 
 
 
500 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.102695  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  25.06 
 
 
491 aa  79.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3886  putative RTX secretion protein D  23.73 
 
 
447 aa  77  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.652406  normal  0.810853 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0320  antibiotic ABC transporter  36.36 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0656  bacteriocin ABC transporter, putative  31.39 
 
 
370 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2243  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0168  hypothetical protein  26.54 
 
 
437 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  22.68 
 
 
441 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.66 
 
 
441 aa  70.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16250  Type I secretion membrane fusion protein  23.37 
 
 
441 aa  71.2  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.8 
 
 
441 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1173  hypothetical protein  23.93 
 
 
442 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2264  hypothetical protein  33.96 
 
 
627 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  23.89 
 
 
509 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.48 
 
 
471 aa  67  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  24 
 
 
504 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.32 
 
 
474 aa  66.6  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2559  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.69 
 
 
446 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  23.68 
 
 
509 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2430  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  33.64 
 
 
379 aa  65.9  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.75 
 
 
439 aa  65.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  21.01 
 
 
488 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  21.17 
 
 
508 aa  65.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.47 
 
 
446 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.55639 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1706  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.56 
 
 
431 aa  63.9  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0970  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.35 
 
 
505 aa  63.5  0.000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.995954  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0934  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.73 
 
 
440 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0970473  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0426  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  22.33 
 
 
383 aa  62.8  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0719  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.98 
 
 
438 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1817  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.33 
 
 
455 aa  62.4  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000964329  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02273  HlyD family secretion protein  22.52 
 
 
436 aa  62  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3355  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.04 
 
 
446 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.22 
 
 
473 aa  60.1  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  22.03 
 
 
481 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.75 
 
 
487 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0155  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.27 
 
 
505 aa  58.2  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.353804  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2195  HlyD family secretion protein  41.33 
 
 
471 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2059  HlyD family secretion protein  41.33 
 
 
469 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  21.78 
 
 
515 aa  57.4  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1346  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.83 
 
 
462 aa  57.4  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1406  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.81 
 
 
441 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575733  normal  0.479497 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2399  secretion protein HlyD  19.68 
 
 
467 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105564  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.84 
 
 
430 aa  56.2  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4000  secretion protein HlyD family protein  29.73 
 
 
457 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001279  membrane-fusion protein  21.35 
 
 
446 aa  56.6  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  21.79 
 
 
424 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1797  HlyD family secretion protein  22.63 
 
 
441 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250049  normal  0.0164192 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.83 
 
 
491 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  32.31 
 
 
457 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0473  secretion protein HylD  29.73 
 
 
457 aa  55.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  31.17 
 
 
330 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1643  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.73 
 
 
453 aa  55.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.87 
 
 
460 aa  55.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.61 
 
 
436 aa  55.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.848242  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.49 
 
 
439 aa  54.7  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1759  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.14 
 
 
518 aa  54.7  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0119826 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.12 
 
 
421 aa  54.3  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1281  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.45 
 
 
454 aa  54.3  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4083  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.11 
 
 
442 aa  53.9  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0246  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.44 
 
 
480 aa  53.9  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.777594  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.33 
 
 
447 aa  53.9  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2681  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.14 
 
 
449 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2862  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.26 
 
 
455 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.07 
 
 
460 aa  53.5  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.97 
 
 
460 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4909  secretion protein HlyD family protein  31.31 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.070438 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.97 
 
 
460 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0133  HlyD family hemolysin secretion protein  20.36 
 
 
442 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.97 
 
 
460 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2740  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.59 
 
 
448 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.97 
 
 
460 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2967  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  20.59 
 
 
448 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34356  normal  0.656863 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3891  HlyD family hemolysin secretion protein  19.96 
 
 
442 aa  52.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0584  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.24 
 
 
455 aa  52.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.0809109 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  31.87 
 
 
484 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.44 
 
 
440 aa  52  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0893  RTX secretion protein D  22.76 
 
 
433 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.87 
 
 
460 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.87 
 
 
460 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1747  secretion protein HlyD family protein  34.15 
 
 
393 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.570517  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.76 
 
 
433 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.768701  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2611  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.16 
 
 
549 aa  51.6  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3329  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.09 
 
 
417 aa  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40218  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1002  putative secretion protein  20.39 
 
 
431 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1320  putative secretion protein  20.39 
 
 
431 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600864  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1732  putative secretion protein  20.39 
 
 
431 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0289  secretion protein, putative  20.39 
 
 
431 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1816  putative secretion protein  20.39 
 
 
431 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0165273  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1140  secretion protein, putative  20.65 
 
 
431 aa  51.6  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  34.65 
 
 
463 aa  51.6  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0215  secretion protein HlyD  27.15 
 
 
314 aa  51.6  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.509726  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0275  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.4 
 
 
481 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.07 
 
 
511 aa  52  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0276  putative secretion protein  20.39 
 
 
431 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396567  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  38.27 
 
 
302 aa  51.2  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  19.35 
 
 
471 aa  51.2  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0544  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 
576 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212185  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1562  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.01 
 
 
440 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2986  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.84 
 
 
443 aa  50.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>