More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0274 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  100 
 
 
358 aa  697    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  59.37 
 
 
354 aa  401  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  55.39 
 
 
357 aa  373  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  54.29 
 
 
357 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0485  transport system permease protein  54.31 
 
 
357 aa  362  6e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.644371  hitchhiker  0.000336075 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  49.86 
 
 
348 aa  352  7e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  49.86 
 
 
348 aa  351  8.999999999999999e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  48.3 
 
 
340 aa  347  2e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  50.14 
 
 
348 aa  345  8e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  49.57 
 
 
359 aa  340  2e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  48.56 
 
 
356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  48.71 
 
 
349 aa  338  7e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  54.95 
 
 
370 aa  330  3e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  46.05 
 
 
355 aa  330  3e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  50.32 
 
 
336 aa  325  7e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  46.65 
 
 
344 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  46.65 
 
 
344 aa  318  1e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  47.71 
 
 
356 aa  315  7e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1652  transport system permease protein  51.42 
 
 
357 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1175  iron ABC transporter permease  47.34 
 
 
359 aa  290  3e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1822  transport system permease protein  47.83 
 
 
350 aa  288  1e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0344  transport system permease protein  44.94 
 
 
363 aa  287  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2148  transport system permease protein  46.13 
 
 
356 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.176717 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  48.6 
 
 
346 aa  282  7.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0220  transport system permease protein  46.02 
 
 
356 aa  277  3e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  41.39 
 
 
355 aa  253  3e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  41.39 
 
 
350 aa  249  5e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  38.08 
 
 
373 aa  245  9e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  38.12 
 
 
360 aa  242  9e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  34.97 
 
 
374 aa  233  5e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  36.36 
 
 
362 aa  232  9e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  37.2 
 
 
375 aa  230  3e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  37.29 
 
 
383 aa  229  7e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0290  transport system permease protein  39.14 
 
 
361 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.602088  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  36.71 
 
 
367 aa  221  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1186  transport system permease protein  38.4 
 
 
369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  36.27 
 
 
331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  37.09 
 
 
362 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1041  transport system permease protein  42.91 
 
 
301 aa  211  1e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0815  transport system permease protein  39.11 
 
 
346 aa  211  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  36.29 
 
 
347 aa  209  6e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2398  hypothetical protein  39.44 
 
 
361 aa  208  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0990  transport system permease protein  38.68 
 
 
378 aa  206  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  38.05 
 
 
343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1703  heme/hemin ABC transporter, permease protein  32.13 
 
 
352 aa  197  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  34.17 
 
 
357 aa  197  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  38.48 
 
 
365 aa  197  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  33.53 
 
 
356 aa  192  8e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2028  transport system permease protein  37.04 
 
 
356 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  40.8 
 
 
315 aa  191  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2250  transport system permease protein  36.18 
 
 
356 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1219  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  34.27 
 
 
360 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.11373  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0744  transport system permease protein  33.98 
 
 
345 aa  189  4e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.290337 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2734  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  36.89 
 
 
347 aa  189  7e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000167037  hitchhiker  0.000165993 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  34.15 
 
 
330 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  33.07 
 
 
359 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  32.86 
 
 
356 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  34.14 
 
 
330 aa  186  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  38.65 
 
 
363 aa  186  8e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4419  transport system permease protein  34.77 
 
 
355 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347706 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  40.27 
 
 
315 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  32.11 
 
 
342 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  33.93 
 
 
345 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2697  transport system permease protein  38.12 
 
 
352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  32.39 
 
 
342 aa  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0179  transport system permease protein  37.2 
 
 
326 aa  180  4e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3090  transport system permease protein  33.89 
 
 
360 aa  180  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  35.28 
 
 
370 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  34.3 
 
 
381 aa  179  9e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3610  transport system permease protein  34.96 
 
 
360 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0214  iron chelate ABC transporter permease protein  35.24 
 
 
328 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  35.31 
 
 
371 aa  178  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  32.96 
 
 
342 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  34.78 
 
 
366 aa  177  3e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  32.68 
 
 
342 aa  176  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  37.27 
 
 
312 aa  176  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  35.14 
 
 
325 aa  175  9e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  34.83 
 
 
345 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  34.83 
 
 
345 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  34.83 
 
 
342 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  34.83 
 
 
342 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12518  iron(III) ABC transporter, permease protein, putative  35.28 
 
 
340 aa  175  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  34.65 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  36.52 
 
 
338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  33.24 
 
 
337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  39.19 
 
 
334 aa  173  5e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  39.19 
 
 
334 aa  173  5e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1425  transport system permease protein  38.78 
 
 
345 aa  172  9e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  33.43 
 
 
355 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  34.89 
 
 
342 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0976  transport system permease protein  33.15 
 
 
385 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  36.8 
 
 
363 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1010  transport system permease protein  33.15 
 
 
364 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  34.98 
 
 
347 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1284  transport system permease protein  38.64 
 
 
338 aa  171  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.601831 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0213  putative ferrichrome ABC transporter permease  35.37 
 
 
328 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0834  ABC transporter permease  35.55 
 
 
359 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  33.8 
 
 
368 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  36.25 
 
 
363 aa  170  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3365  transport system permease protein  33.15 
 
 
364 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>