More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0243 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 206 aa  419  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  47.26 
 
 		 210 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  40 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  40 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  56.35 
 
 		 137 aa  149  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  49.25 
 
 		 134 aa  137  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  49.25 
 
 		 134 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  35.12 
 
 		 220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  36 
 
 		 214 aa  135  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  48.51 
 
 		 134 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  33.83 
 
 		 222 aa  134  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  44.9 
 
 		 221 aa  134  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  34.83 
 
 		 220 aa  134  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  42.86 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  34.45 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1521  TrkA-N domain protein  34.5 
 
 		 220 aa  132  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709024  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  44.14 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  46.43 
 
 		 219 aa  131  6.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  45.52 
 
 		 134 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  43.26 
 
 		 223 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  43.26 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  34.5 
 
 		 214 aa  128  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  43.61 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  31.22 
 
 		 264 aa  126  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  34.5 
 
 		 223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  45.86 
 
 		 219 aa  124  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01270  K+ transport system, NAD-binding component  44.14 
 
 		 219 aa  124  8.000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  43.75 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  41.98 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1562  TrkA-N domain protein  31.73 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  42.75 
 
 		 224 aa  121  6e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  41.79 
 
 		 221 aa  121  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0253  TrkA-N domain protein  43.94 
 
 		 138 aa  120  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  32.66 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3756  TrkA-N domain protein  31.47 
 
 		 236 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000258956  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1405  TrkA-N domain protein  43.65 
 
 		 218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.364271  normal  0.729476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  42.86 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2197  TrkA-N  32.82 
 
 		 217 aa  118  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2243  TrkA domain-containing protein  32.82 
 
 		 217 aa  118  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2186  TrkA domain-containing protein  32.82 
 
 		 217 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0106506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1708  TrkA-N domain protein  31.77 
 
 		 216 aa  115  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0311888  normal  0.0547174 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  31.98 
 
 		 233 aa  114  6.9999999999999995e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  41.98 
 
 		 224 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  41.48 
 
 		 242 aa  112  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1942  TrkA-N domain protein  43.75 
 
 		 216 aa  112  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0161521 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  42.19 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  38.17 
 
 		 141 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  44.27 
 
 		 222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5191  TrkA domain-containing protein  30.73 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0357985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  31.07 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1923  TrkA-N domain protein  34.98 
 
 		 220 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1656  TrkA domain-containing protein  42.11 
 
 		 143 aa  106  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153236  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1729  TrkA domain-containing protein  41.35 
 
 		 143 aa  105  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000411585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2911  TrkA-N domain protein  38.85 
 
 		 142 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0359474  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  29.47 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  40.46 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  40.46 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  30.6 
 
 		 221 aa  97.4  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  31.15 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  28.57 
 
 		 221 aa  96.7  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  29.91 
 
 		 226 aa  96.7  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  38.93 
 
 		 221 aa  96.7  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  38.93 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  29.47 
 
 		 228 aa  93.2  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  38.69 
 
 		 458 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  30.05 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  36.76 
 
 		 457 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  36.76 
 
 		 457 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  30.14 
 
 		 225 aa  88.2  8e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  29.35 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1685  TrkA domain-containing protein  33.59 
 
 		 153 aa  86.3  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.124287  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  35.77 
 
 		 458 aa  86.3  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  43.43 
 
 		 465 aa  85.5  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0017  potassium transporter peripheral membrane component  42.48 
 
 		 458 aa  84.7  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2079  TrkA-N domain protein  28.02 
 
 		 225 aa  84.7  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  31.68 
 
 		 628 aa  84.7  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  36.03 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  25.87 
 
 		 620 aa  84.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  36.03 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  36.03 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  36.03 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1919  TrkA domain-containing protein  39.32 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  35.77 
 
 		 458 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  35.77 
 
 		 458 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  35.04 
 
 		 458 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  35.04 
 
 		 458 aa  82.8  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  26.98 
 
 		 443 aa  83.2  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0020  potassium transporter peripheral membrane component  37.23 
 
 		 459 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.688304  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  35.77 
 
 		 458 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  35.77 
 
 		 458 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  35.77 
 
 		 458 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  35.04 
 
 		 458 aa  82.8  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  25.25 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  35.04 
 
 		 458 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  35.77 
 
 		 458 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  35.77 
 
 		 458 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  35.77 
 
 		 458 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  35.77 
 
 		 458 aa  82.4  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  35.77 
 
 		 458 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  35.77 
 
 		 458 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>