More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0196 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 225 aa  462  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  44.86 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  37.96 
 
 		 232 aa  168  6e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  42.99 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  39.91 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  38.18 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  36.49 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  35.55 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  36.68 
 
 		 253 aa  155  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  37.44 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  40.38 
 
 		 211 aa  148  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  40.67 
 
 		 234 aa  148  7e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  39.17 
 
 		 212 aa  148  8e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  34.26 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  36.49 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  33.18 
 
 		 213 aa  146  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  35.51 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  36.24 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  36.32 
 
 		 245 aa  145  5e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  35.24 
 
 		 217 aa  144  8.000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  35.55 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  38.05 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  35.24 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  35.51 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  34.82 
 
 		 244 aa  142  4e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  35.24 
 
 		 217 aa  142  4e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  34.38 
 
 		 244 aa  142  6e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  35.24 
 
 		 217 aa  141  8e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  35.19 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  34.76 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  34.58 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  34.76 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  39.32 
 
 		 202 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  34.26 
 
 		 234 aa  138  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  34.88 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  36.36 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  37.93 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  34.76 
 
 		 215 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  34.91 
 
 		 264 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  34.29 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  34.53 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  30.57 
 
 		 226 aa  125  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  31.14 
 
 		 226 aa  124  8.000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  33.79 
 
 		 223 aa  122  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  32.38 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  33.81 
 
 		 213 aa  122  5e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  33.81 
 
 		 213 aa  122  5e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  32.86 
 
 		 215 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  32.58 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  32.38 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  32.38 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  34.1 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  37.86 
 
 		 202 aa  119  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  33.94 
 
 		 223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  33.81 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 215 aa  118  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  35.03 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1899  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  32.03 
 
 		 247 aa  99.8  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1974  radical activating enzyme, putative  31.6 
 
 		 251 aa  98.6  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  44.64 
 
 		 220 aa  98.6  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  28.82 
 
 		 230 aa  95.5  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  27.83 
 
 		 216 aa  95.5  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  30.08 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4937  radical SAM domain-containing protein  32.47 
 
 		 245 aa  92.4  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0465202  normal  0.450648 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  32.8 
 
 		 231 aa  92  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  40.54 
 
 		 280 aa  91.3  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  28.44 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  38.79 
 
 		 274 aa  88.2  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  28.29 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  39.81 
 
 		 260 aa  87  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  32.29 
 
 		 216 aa  87.4  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  28.5 
 
 		 205 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  30.74 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  32.88 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  39.55 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  28.5 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  31.53 
 
 		 227 aa  85.9  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  27.94 
 
 		 205 aa  85.1  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0659  Radical SAM domain protein  25.98 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.917391  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1846  Radical SAM domain protein  27.35 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260546  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  44.86 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  28.45 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  26.13 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  37.61 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3495  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  30.74 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  38.53 
 
 		 243 aa  81.6  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  27.94 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  29.78 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  26.54 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  26.11 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  29.33 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  35.29 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1066  radical SAM domain-containing protein  27.63 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1396  radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0288655  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  31.36 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3167  hypothetical protein  26.52 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000157264  normal  0.548962 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3148  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000734892  normal  0.311004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>