194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0182 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 
1338 aa  2752    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  51.12 
 
 
712 aa  464  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  45.38 
 
 
667 aa  414  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  29.96 
 
 
901 aa  326  2e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  41.81 
 
 
535 aa  321  7e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  42.95 
 
 
679 aa  314  6.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  49.05 
 
 
518 aa  311  8e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  47.76 
 
 
530 aa  306  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  49.52 
 
 
518 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  49.84 
 
 
1585 aa  294  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  51.07 
 
 
508 aa  291  4e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  44.41 
 
 
500 aa  276  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  37.88 
 
 
1186 aa  267  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  37.09 
 
 
665 aa  243  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  37.15 
 
 
746 aa  202  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  33.61 
 
 
533 aa  200  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  31.01 
 
 
618 aa  199  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  31.14 
 
 
524 aa  189  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  32.49 
 
 
509 aa  189  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  34.98 
 
 
1195 aa  183  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  29.88 
 
 
464 aa  178  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  35.63 
 
 
572 aa  177  9e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  34.73 
 
 
532 aa  175  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  34.52 
 
 
521 aa  174  9e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  34.48 
 
 
519 aa  174  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  37.31 
 
 
560 aa  171  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  33.01 
 
 
691 aa  171  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  28.35 
 
 
503 aa  169  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  31 
 
 
401 aa  168  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  36.47 
 
 
562 aa  167  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.25 
 
 
515 aa  164  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  33.57 
 
 
522 aa  164  8.000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  34.27 
 
 
522 aa  164  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  33.74 
 
 
504 aa  162  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  34.03 
 
 
527 aa  162  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  33.87 
 
 
543 aa  162  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  32.19 
 
 
577 aa  161  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  35.09 
 
 
551 aa  160  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.36043 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  30.7 
 
 
383 aa  159  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  32.41 
 
 
536 aa  157  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  28.78 
 
 
450 aa  157  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  32.03 
 
 
532 aa  157  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  30.96 
 
 
522 aa  152  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  29.85 
 
 
563 aa  151  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.54 
 
 
444 aa  150  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  34.32 
 
 
512 aa  150  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.65 
 
 
538 aa  149  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  30.53 
 
 
566 aa  144  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  33.22 
 
 
525 aa  142  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  28.94 
 
 
581 aa  140  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  28.21 
 
 
556 aa  139  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  35.93 
 
 
317 aa  138  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  30.65 
 
 
516 aa  138  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.27 
 
 
558 aa  135  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  26.35 
 
 
542 aa  130  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  28.81 
 
 
517 aa  128  7e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  27.69 
 
 
484 aa  128  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  31.5 
 
 
348 aa  126  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  32.82 
 
 
315 aa  126  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  29.32 
 
 
532 aa  126  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  33.12 
 
 
315 aa  125  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.84 
 
 
536 aa  125  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  34.01 
 
 
317 aa  125  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  29.81 
 
 
571 aa  125  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  33.12 
 
 
315 aa  124  8e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  29.47 
 
 
550 aa  124  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  31.09 
 
 
302 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.09 
 
 
537 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  28.01 
 
 
497 aa  123  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  29.77 
 
 
523 aa  121  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.72 
 
 
537 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  32.92 
 
 
468 aa  120  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  31.16 
 
 
636 aa  119  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  30.84 
 
 
514 aa  119  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  27.62 
 
 
541 aa  119  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  33.59 
 
 
540 aa  117  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.21 
 
 
539 aa  117  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  33.79 
 
 
311 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  26.63 
 
 
451 aa  117  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  31.45 
 
 
311 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  30.79 
 
 
326 aa  116  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.7 
 
 
546 aa  115  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  26.86 
 
 
586 aa  114  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  31.38 
 
 
383 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.96 
 
 
541 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  26.62 
 
 
497 aa  114  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.15 
 
 
488 aa  112  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  28.15 
 
 
526 aa  112  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.23 
 
 
344 aa  111  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  29.3 
 
 
512 aa  110  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.6 
 
 
558 aa  105  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.77 
 
 
346 aa  105  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  26.33 
 
 
492 aa  104  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.24 
 
 
316 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.05 
 
 
559 aa  103  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  25.56 
 
 
539 aa  103  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.07 
 
 
547 aa  103  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  29.17 
 
 
553 aa  102  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  28.03 
 
 
546 aa  101  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.69 
 
 
346 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>