59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0181 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0181  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 595 aa  1211    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000497192  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1595  extracellular solute-binding protein family 1  27.89 
 
 		 440 aa  131  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.780174  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1585  extracellular solute-binding protein family 1  28.14 
 
 		 442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  27.34 
 
 		 454 aa  72.8  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1046  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  26.61 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  24.51 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.03 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2265  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000515551  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 		 417 aa  57  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  28.44 
 
 		 480 aa  57  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  22.75 
 
 		 437 aa  57  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 		 425 aa  57  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1283  extracellular solute-binding lipoprotein, putative  26.01 
 
 		 436 aa  56.6  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  22.75 
 
 		 437 aa  57  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0529  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 464 aa  56.2  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.361956  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.99 
 
 		 419 aa  53.9  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 		 421 aa  52.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 		 425 aa  52.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.96 
 
 		 443 aa  51.2  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 		 449 aa  50.8  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 410 aa  50.4  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  23.8 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 455 aa  49.7  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0253  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.53 
 
 		 424 aa  49.3  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 411 aa  49.7  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3566  extracellular solute-binding protein family 1  32.26 
 
 		 426 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  23.49 
 
 		 411 aa  48.9  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.31 
 
 		 431 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0589  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 414 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 419 aa  47.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4984  extracellular solute-binding protein family 1  23.18 
 
 		 432 aa  48.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000108283  decreased coverage  0.000897425 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  21.43 
 
 		 439 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 420 aa  47.8  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1068  sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  30.26 
 
 		 390 aa  47.8  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.238718 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0528  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  30 
 
 		 414 aa  47.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 395 aa  47.8  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 420 aa  47.8  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  29.92 
 
 		 415 aa  47.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6794  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 		 430 aa  47.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 		 504 aa  47  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  22.97 
 
 		 420 aa  47  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0758  extracellular solute-binding protein family 1  22.49 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.76 
 
 		 464 aa  45.8  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  22.71 
 
 		 442 aa  45.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 		 432 aa  45.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 		 436 aa  45.4  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.35 
 
 		 438 aa  45.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 		 479 aa  44.7  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  22.67 
 
 		 421 aa  44.7  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0630  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 483 aa  43.9  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.679852 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.16 
 
 		 407 aa  43.9  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 393 aa  43.5  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0849  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 		 558 aa  43.5  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.206456  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 391 aa  43.5  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  22.86 
 
 		 419 aa  43.5  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>