49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0097 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0097  Glucosylceramidase  100 
 
 
446 aa  921    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04190  glycoside hydrolase family 30  49.32 
 
 
445 aa  460  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  46.05 
 
 
476 aa  439  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  46.05 
 
 
485 aa  433  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1268  glucosylceramidase  44.75 
 
 
475 aa  426  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  44.79 
 
 
487 aa  416  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0858  glycoside hydrolase family protein  46.81 
 
 
445 aa  397  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1562  glycoside hydrolase family protein  47.02 
 
 
487 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3404  glycoside hydrolase family protein  42.44 
 
 
441 aa  350  3e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4708  O-Glycosyl hydrolase family 30  37.35 
 
 
447 aa  319  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.319201  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3714  glycosy hydrolase family protein  31.45 
 
 
567 aa  248  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171767  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0296  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  35.04 
 
 
484 aa  244  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  33.12 
 
 
505 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  34.05 
 
 
486 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  33.8 
 
 
485 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  34.21 
 
 
480 aa  227  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  34.22 
 
 
472 aa  220  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54536  predicted protein  31.31 
 
 
859 aa  221  3e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  30.99 
 
 
648 aa  219  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0445  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.8 
 
 
501 aa  218  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.39 
 
 
695 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  33.41 
 
 
474 aa  210  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.4 
 
 
627 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.41 
 
 
603 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  29.56 
 
 
488 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  32.36 
 
 
514 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  30.89 
 
 
666 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34530  O-glycosyl hydrolase  32.14 
 
 
447 aa  194  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0928159  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2994  glucosylceramidase  31.29 
 
 
481 aa  192  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389806  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1833  O-glycosyl hydrolase  32.45 
 
 
445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3362  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.47 
 
 
497 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183475  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  29.82 
 
 
982 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  31.45 
 
 
603 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1516  glycoside hydrolase family 30  27.4 
 
 
481 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  27.96 
 
 
634 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  28.22 
 
 
647 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5017  glycoside hydrolase family 30  27.86 
 
 
484 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000784671  normal  0.283576 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  23.81 
 
 
532 aa  88.2  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  23.06 
 
 
406 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  19.01 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  21.07 
 
 
726 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  21.12 
 
 
688 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  20.6 
 
 
982 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  24.38 
 
 
629 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4557  O-Glycosyl hydrolase-like protein  22.77 
 
 
494 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00623956  normal  0.0160771 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  22.01 
 
 
630 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  19.32 
 
 
681 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  23.17 
 
 
1217 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1486  glycoside hydrolase family 30  20.99 
 
 
544 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.291924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>