53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0040 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0040  ABC-2 type transporter  100 
 
 
313 aa  608  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1782  hypothetical protein  27.03 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000438191  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2524  ABC-2 type transporter  29.21 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.824242  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3060  hypothetical protein  28.42 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726847  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1357  hypothetical protein  27.69 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.124612  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1722  hypothetical protein  28.26 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3231  hypothetical protein  24.37 
 
 
357 aa  65.9  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0411877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2418  hypothetical protein  26.49 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1740  hypothetical protein  28.65 
 
 
334 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3514  hypothetical protein  34.78 
 
 
304 aa  56.2  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0261  ABC transporter, permease protein, putative  32.8 
 
 
357 aa  51.2  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.822784  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 
370 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  28.47 
 
 
405 aa  49.3  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0086  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 
322 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  32 
 
 
383 aa  47.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2042  hypothetical protein  25 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.575952  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3147  hypothetical protein  24.76 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0757  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  26.84 
 
 
367 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.329379 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  29.49 
 
 
294 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  26.4 
 
 
379 aa  46.6  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  25.43 
 
 
289 aa  46.2  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  24.73 
 
 
972 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  28.86 
 
 
377 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  33.64 
 
 
372 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  32.94 
 
 
368 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  32.94 
 
 
368 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  27.62 
 
 
374 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  27.62 
 
 
356 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  26.81 
 
 
377 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  32.94 
 
 
368 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.95 
 
 
307 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  25.31 
 
 
377 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  30.28 
 
 
244 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  24.22 
 
 
964 aa  43.5  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3736  hypothetical protein  20.81 
 
 
370 aa  43.1  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  28.93 
 
 
373 aa  43.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  25.93 
 
 
378 aa  43.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  24.06 
 
 
376 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  32.67 
 
 
377 aa  43.1  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  27.72 
 
 
380 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  34.65 
 
 
368 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  27.27 
 
 
366 aa  42.7  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  27.27 
 
 
369 aa  42.7  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  34.65 
 
 
368 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  30.28 
 
 
943 aa  42.7  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  34.65 
 
 
368 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  34.65 
 
 
368 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  34.65 
 
 
368 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  30.97 
 
 
275 aa  42.4  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  41.86 
 
 
271 aa  42.4  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  26.53 
 
 
377 aa  42.4  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0697  hypothetical protein  26.83 
 
 
373 aa  42.4  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0715  hypothetical protein  26.83 
 
 
373 aa  42.4  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>