247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0033 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  100 
 
 
189 aa  384  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  64.86 
 
 
192 aa  249  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  67.28 
 
 
187 aa  232  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  67.28 
 
 
208 aa  231  6e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  58.7 
 
 
185 aa  223  9e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  56.68 
 
 
186 aa  203  1e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  56.97 
 
 
185 aa  201  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  50.99 
 
 
202 aa  194  5.000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  46.35 
 
 
193 aa  179  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  47.73 
 
 
183 aa  178  4e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  49.46 
 
 
201 aa  177  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  45.83 
 
 
217 aa  176  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  46.35 
 
 
193 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0999  LemA family protein  50.91 
 
 
194 aa  169  3e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  45.92 
 
 
197 aa  166  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  46.94 
 
 
196 aa  166  2e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  49.34 
 
 
183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  48.15 
 
 
184 aa  164  5.9999999999999996e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  44.39 
 
 
192 aa  164  9e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3482  LemA family protein  43.81 
 
 
201 aa  161  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.399994 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  48.17 
 
 
188 aa  161  6e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1721  hypothetical protein  44.44 
 
 
244 aa  161  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  40.22 
 
 
184 aa  159  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06990  hypothetical protein  45.76 
 
 
202 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  45.68 
 
 
186 aa  158  4e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  44.77 
 
 
188 aa  158  5e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  45.56 
 
 
181 aa  157  6e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0640  hypothetical protein  45.71 
 
 
202 aa  157  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  42.37 
 
 
183 aa  157  9e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3454  LemA family protein  42.86 
 
 
197 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23113  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  41.48 
 
 
181 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3226  hypothetical protein  41.88 
 
 
208 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.969393  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  43.37 
 
 
196 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1229  LemA family protein  39.2 
 
 
215 aa  155  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0161129 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  42.63 
 
 
197 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04653  LemA family protein  39.79 
 
 
212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0176024  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1190  hypothetical protein  45.65 
 
 
201 aa  154  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  50 
 
 
188 aa  154  7e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2027  LemA family protein  41.36 
 
 
195 aa  153  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90664  normal  0.597952 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  42.64 
 
 
212 aa  152  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1289  hypothetical protein  41.03 
 
 
208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0311306  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  42.08 
 
 
184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6689  hypothetical protein  43.75 
 
 
203 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00582649  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1822  LemA family protein  44.25 
 
 
200 aa  151  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.29832  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  41.9 
 
 
183 aa  151  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1824  LemA family protein  40.4 
 
 
198 aa  150  8e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0438485  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4746  LemA family protein  40.11 
 
 
214 aa  150  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5307  LemA family protein  41.49 
 
 
207 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1695  LemA family protein  41.49 
 
 
207 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.392231  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  40.78 
 
 
183 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2297  LemA family protein  43.98 
 
 
211 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0145217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3874  LemA family protein  43.01 
 
 
211 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.14771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2020  LemA family protein  43.98 
 
 
211 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  42.86 
 
 
188 aa  149  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1371  hypothetical protein  41.92 
 
 
194 aa  149  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117075  hitchhiker  0.000133503 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1982  LemA family protein  43.98 
 
 
211 aa  148  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.400761 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3956  hypothetical protein  42.93 
 
 
202 aa  148  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.992492  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  46.55 
 
 
195 aa  148  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  40.33 
 
 
184 aa  148  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1477  LemA family protein  43.98 
 
 
194 aa  147  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  40.61 
 
 
186 aa  148  6e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3714  hypothetical protein  43.23 
 
 
204 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.774184  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  43.2 
 
 
249 aa  146  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3391  LemA family protein  44.57 
 
 
220 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066637  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  41.36 
 
 
180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1669  LemA family protein  42.19 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39054  normal  0.0232057 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2046  LemA family protein  41.33 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279862  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2276  hypothetical protein  41.97 
 
 
194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.23375e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6372  LemA family protein  41.97 
 
 
246 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00757602  normal  0.786314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  40.22 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4544  LemA family protein  43 
 
 
210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.171752  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2519  LemA family protein  42.93 
 
 
212 aa  145  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1902  hypothetical protein  41.71 
 
 
206 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.519616 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1221  LemA family protein  42.41 
 
 
211 aa  145  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3402  hypothetical protein  42.93 
 
 
203 aa  145  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1774  LemA family protein  43.23 
 
 
201 aa  145  5e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119013  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0453  hypothetical protein  41.45 
 
 
210 aa  144  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  40.49 
 
 
186 aa  144  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  42.07 
 
 
185 aa  145  5e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0409  LemA family protein  41.45 
 
 
210 aa  144  6e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00662835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1298  hypothetical protein  44.83 
 
 
202 aa  144  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0324719  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1333  hypothetical protein  41.67 
 
 
210 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1761  LemA family protein  44.57 
 
 
204 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105862  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6198  hypothetical protein  40.51 
 
 
218 aa  144  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2626  hypothetical protein  42.55 
 
 
208 aa  144  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  42.22 
 
 
196 aa  143  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  40.53 
 
 
194 aa  143  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_004310  BR1822  hypothetical protein  39.69 
 
 
207 aa  143  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1754  hypothetical protein  39.69 
 
 
207 aa  143  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  39.56 
 
 
201 aa  143  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  43.2 
 
 
189 aa  143  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  43.03 
 
 
189 aa  142  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  39.67 
 
 
201 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1074  LemA family protein  42.27 
 
 
204 aa  142  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0658  LemA family protein  43.02 
 
 
206 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.14267  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1081  LemA family protein  38.07 
 
 
207 aa  142  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88944  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0811  hypothetical protein  38.5 
 
 
210 aa  141  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  40.22 
 
 
183 aa  141  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  41.29 
 
 
189 aa  140  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0896  LemA family protein  38.95 
 
 
214 aa  140  9.999999999999999e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.652606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>