More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0022 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  100 
 
 		 819 aa  1665    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  45.4 
 
 		 815 aa  672    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1419  UvrD/REP helicase  25.65 
 
 		 706 aa  174  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  26.42 
 
 		 697 aa  165  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  27.15 
 
 		 710 aa  164  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1352  UvrD/REP helicase  25.05 
 
 		 712 aa  159  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541991 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  27.86 
 
 		 662 aa  153  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2943  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  25.05 
 
 		 696 aa  147  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  25.89 
 
 		 708 aa  147  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2329  superfamily protein I DNA/RNA helicase  24.51 
 
 		 679 aa  145  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  23.88 
 
 		 673 aa  142  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  24.36 
 
 		 696 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  25 
 
 		 712 aa  141  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  25.9 
 
 		 695 aa  139  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000385426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0467  UvrD/REP helicase  23.18 
 
 		 603 aa  137  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82885  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  23.24 
 
 		 716 aa  136  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2325  hypothetical protein  24.18 
 
 		 759 aa  131  5.0000000000000004e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0788129  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  24.42 
 
 		 671 aa  130  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  23.48 
 
 		 690 aa  130  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  25.74 
 
 		 695 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2728  UvrD/REP helicase  24.7 
 
 		 699 aa  129  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4897  UvrD/REP helicase  23.15 
 
 		 705 aa  129  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  24.04 
 
 		 734 aa  128  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0110  putative DNA helicase  22.06 
 
 		 659 aa  128  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3882  UvrD/REP helicase  23.02 
 
 		 704 aa  125  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4831  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.02 
 
 		 704 aa  125  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5811  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  23.02 
 
 		 704 aa  126  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859027 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  26.29 
 
 		 711 aa  124  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8440  UvrD/REP helicase  24.7 
 
 		 685 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2733  UvrD/REP helicase  23.43 
 
 		 705 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0810  UvrD/REP helicase  23.18 
 
 		 703 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0826  UvrD/REP helicase  23.18 
 
 		 703 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  25.74 
 
 		 663 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  21.93 
 
 		 809 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3032  UvrD/REP family ATP-dependent DNA helicase  23.23 
 
 		 687 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.722257  normal  0.242361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  23.11 
 
 		 700 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  27.78 
 
 		 625 aa  110  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  23.24 
 
 		 737 aa  110  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35190  DNA/RNA helicase, superfamily I  23.02 
 
 		 737 aa  106  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  41.88 
 
 		 232 aa  106  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3740  UvrD/REP helicase  22.84 
 
 		 752 aa  103  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3178  LexA repressor  40.31 
 
 		 237 aa  103  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0355  UvrD/REP helicase  22.24 
 
 		 714 aa  103  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3085  UvrD/Rep helicase  23.15 
 
 		 717 aa  102  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.173371  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0145  LexA repressor  39.67 
 
 		 253 aa  100  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0813581  normal  0.028375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  24.85 
 
 		 564 aa  98.6  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3094  LexA repressor  36.15 
 
 		 228 aa  98.6  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1135  LexA repressor  32.45 
 
 		 241 aa  99  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.725643  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  45.61 
 
 		 201 aa  97.8  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  23.45 
 
 		 515 aa  97.4  9e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1729  LexA repressor  38.76 
 
 		 233 aa  97.4  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3249  LexA repressor  41.53 
 
 		 236 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  43.65 
 
 		 222 aa  97.1  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3216  LexA repressor  38.76 
 
 		 224 aa  96.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2454  LexA repressor  40.68 
 
 		 237 aa  96.3  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212024  normal  0.397716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2839  LexA repressor  38.64 
 
 		 235 aa  96.3  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  28.68 
 
 		 619 aa  95.9  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.62 
 
 		 214 aa  95.9  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  38.46 
 
 		 228 aa  95.1  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0832  LexA repressor  38.06 
 
 		 227 aa  95.5  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0630209  hitchhiker  0.00461064 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  26.71 
 
 		 615 aa  95.5  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.22 
 
 		 206 aa  94.7  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  37.42 
 
 		 207 aa  95.1  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1841  LexA repressor  37.69 
 
 		 233 aa  94.7  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.924658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  40.15 
 
 		 206 aa  94.7  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0020  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.54 
 
 		 199 aa  94.4  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000309012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  38.64 
 
 		 223 aa  94.4  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  37.88 
 
 		 269 aa  94.4  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  37.88 
 
 		 269 aa  94  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1997  LexA repressor  35.61 
 
 		 228 aa  94  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2809  LexA repressor  37.12 
 
 		 234 aa  94  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33074  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1479  LexA repressor  42.06 
 
 		 275 aa  93.6  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0381882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  53.41 
 
 		 201 aa  93.6  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0707  LexA repressor  35.61 
 
 		 227 aa  94  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.265887 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  40.34 
 
 		 153 aa  93.2  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  39.16 
 
 		 230 aa  92.8  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  23.55 
 
 		 612 aa  93.2  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  23.81 
 
 		 689 aa  93.2  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0893  SOS-response transcriptional repressor, LexA  45.69 
 
 		 207 aa  93.2  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  23.81 
 
 		 689 aa  93.2  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  37.88 
 
 		 223 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.41 
 
 		 212 aa  92.8  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  38.06 
 
 		 203 aa  92.8  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0793  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.4 
 
 		 198 aa  93.2  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4496  LexA repressor  39.83 
 
 		 232 aa  93.6  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  37.88 
 
 		 223 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  41.09 
 
 		 207 aa  93.2  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  42.37 
 
 		 203 aa  92.4  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  23.81 
 
 		 689 aa  92.4  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  24.64 
 
 		 691 aa  92.4  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2134  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.86 
 
 		 206 aa  92.4  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  38.06 
 
 		 203 aa  92.4  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2883  LexA repressor  36.8 
 
 		 231 aa  92.4  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  37.88 
 
 		 206 aa  92  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  37.88 
 
 		 206 aa  92  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  37.88 
 
 		 206 aa  92  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  37.88 
 
 		 206 aa  92  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2084  SOS-response transcriptional repressor, LexA  45.22 
 
 		 231 aa  92  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507519 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.16 
 
 		 197 aa  91.7  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  23.96 
 
 		 689 aa  91.7  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>