More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0001 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 
454 aa  930  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.31762e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  57.94 
 
 
440 aa  512  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.18947e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  57.02 
 
 
443 aa  499  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  54.08 
 
 
457 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  5.97417e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  54.08 
 
 
457 aa  498  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  58.44 
 
 
443 aa  494  1e-138  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  54.63 
 
 
450 aa  491  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  55.29 
 
 
450 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.47845e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.59 
 
 
453 aa  485  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  2.08022e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  54.65 
 
 
441 aa  475  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  54.77 
 
 
446 aa  475  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.85 
 
 
446 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  2.08181e-06  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  54.79 
 
 
446 aa  473  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  4.59109e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.9 
 
 
454 aa  472  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  54.79 
 
 
446 aa  473  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.63866e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  54.79 
 
 
446 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.44098e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  54.79 
 
 
446 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  4.25777e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  54.79 
 
 
446 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.84902e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  54.79 
 
 
446 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  54.79 
 
 
446 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  54.79 
 
 
446 aa  474  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  54.17 
 
 
442 aa  470  1e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  1.01386e-05 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  54 
 
 
446 aa  471  1e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  54.24 
 
 
446 aa  471  1e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.25337e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.25 
 
 
463 aa  465  1e-130  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.67 
 
 
444 aa  451  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  51.87 
 
 
445 aa  450  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  50.22 
 
 
451 aa  443  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.88 
 
 
453 aa  434  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  49.23 
 
 
453 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  49.23 
 
 
453 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  7.95473e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.13 
 
 
439 aa  430  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.33 
 
 
443 aa  431  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.7 
 
 
449 aa  428  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.41272e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  49.1 
 
 
436 aa  424  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.9 
 
 
439 aa  421  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  1.09214e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  54.37 
 
 
481 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  5.6365e-07  unclonable  1.12062e-05 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  56.93 
 
 
478 aa  405  1e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  3.39822e-05  hitchhiker  3.14878e-05 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  47.14 
 
 
445 aa  406  1e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  55.39 
 
 
480 aa  408  1e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  6.50471e-10 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  43.46 
 
 
472 aa  404  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  3.68077e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  47.4 
 
 
450 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  55.59 
 
 
587 aa  398  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  7.18914e-09  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.93 
 
 
480 aa  396  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.22 
 
 
447 aa  397  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  55.29 
 
 
591 aa  395  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  2.92755e-08 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  59.01 
 
 
527 aa  393  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  59.94 
 
 
570 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000116219  normal  0.231349 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.35 
 
 
721 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  4.23182e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  46.3 
 
 
449 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  58.06 
 
 
528 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0001  DNA replication initiation ATPase- like protein  58.36 
 
 
582 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  5.23076e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  55.72 
 
 
456 aa  391  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0001  chromosomal replication initiation protein  58.82 
 
 
615 aa  385  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  unclonable  4.79277e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  45.54 
 
 
458 aa  385  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  3.04436e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  55.43 
 
 
652 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  5.05913e-06  hitchhiker  0.00770539 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.36 
 
 
461 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  7.04659e-08  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  58.41 
 
 
490 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  45.11 
 
 
460 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.3 
 
 
458 aa  384  1e-105  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.76 
 
 
450 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  47.62 
 
 
470 aa  380  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  44.44 
 
 
482 aa  380  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.09 
 
 
509 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  43.2 
 
 
460 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.6 
 
 
534 aa  376  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  52.79 
 
 
524 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  55.66 
 
 
495 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.6 
 
 
468 aa  373  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  43.36 
 
 
454 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  55.66 
 
 
495 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  54.74 
 
 
492 aa  372  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.96 
 
 
489 aa  375  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  55.66 
 
 
495 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  43.17 
 
 
462 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.81438e-07  unclonable  1.18337e-08 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.01 
 
 
562 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  6.90317e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  55.8 
 
 
494 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  55.49 
 
 
527 aa  372  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  43.04 
 
 
460 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.34 
 
 
566 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  1.50843e-05  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0001  chromosomal replication initiation protein  53.52 
 
 
557 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  54.57 
 
 
452 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.3 
 
 
518 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.7384  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.73 
 
 
476 aa  367  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  2.40109e-09  normal  0.165841 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  42.12 
 
 
456 aa  364  1e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  58.33 
 
 
515 aa  364  2e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  49.32 
 
 
465 aa  364  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  42.95 
 
 
462 aa  364  2e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  4.03403e-07  unclonable  1.36332e-10 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  53.64 
 
 
455 aa  364  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00010  chromosomal replication initiation protein  52.92 
 
 
597 aa  363  4e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  2.78732e-07  normal  0.616682 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.65 
 
 
474 aa  363  4e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  3.98294e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  52.94 
 
 
462 aa  362  5e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.57358e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  52.94 
 
 
462 aa  362  5e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.57699e-06  unclonable  1.21376e-05 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  52.94 
 
 
462 aa  362  5e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  9.98931e-09  unclonable  3.43779e-12 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  52.94 
 
 
460 aa  362  5e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  7.24276e-06  unclonable  1.76e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  52.94 
 
 
462 aa  362  5e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  5.62887e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  52.94 
 
 
460 aa  362  6e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.79736e-07  unclonable  3.13535e-11 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  42.8 
 
 
453 aa  362  6e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  52.94 
 
 
460 aa  362  6e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  43.36 
 
 
461 aa  362  6e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  2.63579e-08  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>