294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_R0055 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_R0055  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0053  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000600525 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30530  tRNA-Ala  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.601239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0003  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.10591  normal  0.264536 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0043  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.05432  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19780  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1441  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000019523  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1359  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0019  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.23026 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0052  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0040  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14015  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00298492  normal  0.41958 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0053  tRNA-Ala  91.89 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18170  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.251001  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0047  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0043  tRNA-Ala  97.92 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0051  tRNA-Ala  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0870511  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0038  tRNA-Ala  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.559626  normal  0.321441 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0008  tRNA-Ala  93.1 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.594698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0023  tRNA-Ala  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0933742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0060  tRNA-Ala  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0023  tRNA-Ala  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265478  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0045  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0042  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.23769  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0042  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0048  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0054  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0054  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0058  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000131227  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0024  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.746229  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309286  tRNA-Ala  91.38 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0564631 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23850  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0033  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.209618  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0034  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31263  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0019  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0021  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t02  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0460294  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11600  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.589046 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0019  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.495919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0056  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000109894  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0049  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0044  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.695473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0029  tRNA-Ala  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.978783  normal  0.786802 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0032  tRNA-Ala  88.06 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.201714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0075  tRNA-Ala  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0048  tRNA-Ala  88.06 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0971605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0002  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0010  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.172147  normal  0.574925 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0009  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6031  tRNA-Val  92.59 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.54533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0016  tRNA-Ala  93.48 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0063  tRNA-Ala  86.49 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0002  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0010  tRNA-Ala  86.49 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0011  tRNA-Ala  86.49 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1917  tRNA-Ala  86.49 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32630  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.319038  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t40  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0044  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0007  tRNA-Ala  87.69 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.110552  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0020  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.342024  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0057  tRNA-Ala  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.117051  hitchhiker  0.00489854 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1816  tRNA-Ala  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0043  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.734011 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0043  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4339  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838936  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0046  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0016  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0046  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.137197 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.177438  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2834  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000118902  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0057  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0012  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.453962  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0013  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0012  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.556924 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0027  tRNA-Val  90.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.532393  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0038  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59206  normal  0.592226 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_265  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0028  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0970246  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0027  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0770393  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0018  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0012  tRNA-Val  90.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.230814  normal  0.0269943 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0012  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000301607  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13160  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.10655  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0026  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.635837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0017  tRNA-Ala  87.1 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0045  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0695113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0015  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01010  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0011  tRNA-Ala  87.1 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00874285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0049  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0013  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna086  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000772007  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0005  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.435087  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4328  tRNA-Val  91.11 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0030  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0054  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.243452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0024  tRNA-Val  91.11 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.540332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>