299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_R0054 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_R0052  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000423304 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0051  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000159293 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0053  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00198096  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0054  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00220789  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0018  tRNA-Met  98.61 
 
 		 77 bp  135  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0046  tRNA-Met  98.61 
 
 		 77 bp  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0668853 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0013  tRNA-Met  98.61 
 
 		 77 bp  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156477  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0051  tRNA-Met  98.61 
 
 		 77 bp  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0332583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0047  tRNA-Met  98.61 
 
 		 77 bp  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.985232  normal  0.0659545 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0030  tRNA-Met  98.61 
 
 		 74 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27400  tRNA-Met  97.22 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0222843  normal  0.668834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0048  tRNA-Met  97.22 
 
 		 74 bp  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0049  tRNA-Met  97.22 
 
 		 74 bp  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0040  tRNA-Met  97.22 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27450  tRNA-Met  97.22 
 
 		 74 bp  127  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0012  tRNA-Met  97.22 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.212092  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0050  tRNA-Met  97.22 
 
 		 74 bp  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0359841 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0021  tRNA-Met  97.22 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.097858  normal  0.0168782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0054  tRNA-Met  97.22 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0025  tRNA-Met  97.22 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0027  tRNA-Met  97.22 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0054  tRNA-Met  97.22 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0071  tRNA-Met  97.22 
 
 		 74 bp  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.503532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0072  tRNA-Met  97.22 
 
 		 74 bp  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0063  tRNA-Met  97.22 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07670  tRNA-Met  97.22 
 
 		 74 bp  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0049  tRNA-Met  97.22 
 
 		 74 bp  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0026  tRNA-Met  97.22 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0051  tRNA-Met  97.22 
 
 		 74 bp  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0055  tRNA-Met  97.22 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0020  tRNA-Met  97.22 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.152661  normal  0.0163497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0062  tRNA-Met  97.22 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0049  tRNA-Met  97.18 
 
 		 77 bp  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297044  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0050  tRNA-Met  97.18 
 
 		 77 bp  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0424906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0013  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0374183  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0042  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101529  hitchhiker  0.00000213655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0010  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0015  tRNA-Met  95.83 
 
 		 74 bp  119  9e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.74865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0026  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0009  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0013  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0256009 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14038  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.704377 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0009  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0051  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14980  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.014365  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0022  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0158353  normal  0.287055 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0050  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19050  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0023  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0024  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0047  tRNA-Met  93.06 
 
 		 74 bp  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182581 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19530  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241373  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0057  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000630751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0029  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000365135 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0131  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.14207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0046  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150428  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0022  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000159989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0052  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4566  tRNA-Met  91.89 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236234  normal  0.0841904 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0224  tRNA-Met  91.89 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000093753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0082  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000739583  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5037  tRNA-Met  91.89 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.794581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0039  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0035  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.84698e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0013  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5049  tRNA-Met  91.89 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0062  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0081  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000214937  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1356  tRNA-Met  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.969712 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0005  tRNA-Met  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4773  tRNA-Met  90.54 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000665438  hitchhiker  6.54659e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5667  tRNA-Met  90.54 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000879492  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5675  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000376256  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5699  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000350684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5720  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0159176  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-2  tRNA-Met  90.54 
 
 		 80 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0182265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-5  tRNA-Met  90.54 
 
 		 80 bp  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.996221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-6  tRNA-Met  90.54 
 
 		 80 bp  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00001255  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-2  tRNA-Met  90.54 
 
 		 80 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0383767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-3  tRNA-Met  90.54 
 
 		 80 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000267735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-5  tRNA-Met  90.54 
 
 		 80 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000520832  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-8  tRNA-Met  90.54 
 
 		 80 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0042  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0073  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5678  tRNA-Met  90.54 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-2  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.527253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-4  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000768608  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-6  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00021362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0282  tRNA-Met  90.54 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0865  tRNA-Met  90.54 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000813952  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5022  tRNA-Met  90.54 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00192595  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0109  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000630943  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0529  tRNA-Met  90.54 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1797900000000004e-29 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0060  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5710  tRNA-Met  90.54 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0058  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263555  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0604  tRNA-Met  90.54 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000969852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5737  tRNA-Met  90.54 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000112746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5807  tRNA-Met  90.54 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00231597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0306  tRNA-Met  90.54 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>