50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_R0046 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_R0046  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216845  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0044  tRNA-His  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000143676 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09670  tRNA-His  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.253938  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0023  tRNA-His  98.04 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00261193  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0015  tRNA-His  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24880  tRNA-His  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737137 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19680  tRNA-His  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0036  tRNA-His  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.435754 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0038  tRNA-His  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0047  tRNA-His  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.627276  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0014  tRNA-His  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0082  tRNA-His  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0030  tRNA-His  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.142316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28660  tRNA-His  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0457487 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0069  tRNA-His  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0039  tRNA-His  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.639716  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0040  tRNA-His  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.646222  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0024  tRNA-His  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0021  tRNA-His  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0060  tRNA-His  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0042  tRNA-His  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0019  tRNA-His  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0563192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0020  tRNA-His  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.889352  normal  0.733975 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0623  tRNA-His  86.21 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0104886  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0027  tRNA-His  84.85 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000556999  normal  0.160274 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0023  tRNA-His  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000017569  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08830  tRNA-His  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0406412  normal  0.0611739 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0029  tRNA-His  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.499357  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0023  tRNA-His  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0002  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1158  tRNA-Phe  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0039  tRNA-His  89.58 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0041  tRNA-His  86.44 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0022  tRNA-His  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0016  tRNA-His  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0043  tRNA-His  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0012  tRNA-Pro  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.189557  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0063  tRNA-His  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0042  tRNA-His  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0037  tRNA-His  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.28441  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0088  tRNA-His  84.13 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000578887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0021  tRNA-His  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.203803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0042  tRNA-His  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.187364  normal  0.613143 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0022  tRNA-His  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.243573 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0028  tRNA-His  88 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.252923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0041  tRNA-His  88 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0113138  normal  0.890079 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0044  tRNA-His  88 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000342103  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0021  tRNA-His  88 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000077385  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0011  tRNA-His  88 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0053  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460889  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>