32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_R0013 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_R0013  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0012  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03580  tRNA-Ser  97.73 
 
 		 92 bp  79.8  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.731888  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0056  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 92 bp  60  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0005  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0058  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 92 bp  60  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.479473  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0057  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 92 bp  60  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0062  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0055  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 92 bp  60  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0006  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14044  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0590766  normal  0.664397 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0004  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 92 bp  60  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2818  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  54  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000985587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0969  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  54  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000352025  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1149  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  54  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000101348  hitchhiker  0.0000000000000214207 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0006  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07240  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0320556  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0041  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0057  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0043  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86437  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2165  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00542927  normal  0.154256 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2065  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000178932  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2161  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000713726  normal  0.978327 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2218  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00379666  normal  0.543792 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00032  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000331013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0048  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171886  normal  0.292826 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0066  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal  0.681656 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5040  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4672  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000507057  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0043  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0020807  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0045  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0142063  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0054  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>