87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4284 on replicon NC_008538
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  100 
 
 		 360 aa  734    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4510  CHAP domain-containing protein  62.53 
 
 		 359 aa  447  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4183  CHAP domain-containing protein  62.78 
 
 		 358 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4551  CHAP domain containing protein  61.8 
 
 		 357 aa  434  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.374294 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  46.09 
 
 		 546 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4426  CHAP domain containing protein  32.75 
 
 		 635 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.649059 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2807  hypothetical protein  48.65 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0224369  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2395  hypothetical protein  47.54 
 
 		 261 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2527  hypothetical protein  39.22 
 
 		 272 aa  96.3  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000287689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2543  hypothetical protein  45.08 
 
 		 275 aa  93.2  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.578338  decreased coverage  0.00000438668 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  37.95 
 
 		 379 aa  92.8  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.44 
 
 		 329 aa  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3348  hypothetical protein  39.67 
 
 		 194 aa  90.9  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.372059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2985  hypothetical protein  39.67 
 
 		 194 aa  90.9  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0244  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  90.5  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3471  hypothetical protein  39.67 
 
 		 194 aa  90.5  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2319  hypothetical protein  39.67 
 
 		 194 aa  90.1  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229041  normal  0.0161406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1977  hypothetical protein  39.67 
 
 		 194 aa  90.1  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3999  hypothetical protein  39.67 
 
 		 194 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4187  hypothetical protein  39.67 
 
 		 194 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3211  hypothetical protein  39.67 
 
 		 193 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2042  hypothetical protein  39.67 
 
 		 194 aa  88.6  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4302  hypothetical protein  37.43 
 
 		 305 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.628164 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2996  hypothetical protein  38.84 
 
 		 194 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0072  hypothetical protein  38.84 
 
 		 200 aa  87.8  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.736738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3850  hypothetical protein  38.84 
 
 		 194 aa  87.8  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1141  hypothetical protein  41.8 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.617877  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4522  hypothetical protein  36.08 
 
 		 275 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2414  hypothetical protein  38.84 
 
 		 203 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.291745 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0974  hypothetical protein  46.36 
 
 		 321 aa  87  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2417  hypothetical protein  38.84 
 
 		 194 aa  86.7  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0954159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5084  hypothetical protein  38.84 
 
 		 207 aa  86.7  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000555714 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1131  hypothetical protein  46.62 
 
 		 301 aa  86.3  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  42.11 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4738  peptidase M23B  40.41 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208513 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  38.46 
 
 		 437 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  38.46 
 
 		 437 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25980  hypothetical protein  38.1 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2275  hypothetical protein  33.99 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329742  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3460  hypothetical protein  38.62 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1090  hypothetical protein  42.62 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.018463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  37.6 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.41 
 
 		 547 aa  81.3  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3840  hypothetical protein  38.41 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4566  hypothetical protein  37.19 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.252363 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2128  hypothetical protein  31.76 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  hitchhiker  0.00659313 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0996  hypothetical protein  42.45 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1845  hypothetical protein  41.67 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.661954  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  38.52 
 
 		 320 aa  75.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.88 
 
 		 554 aa  73.9  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0633  Co/Zn/Cd efflux system component  40.54 
 
 		 312 aa  72.4  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0706968  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0493  hypothetical protein  29.78 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.580154  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11160  hypothetical protein  33.57 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  38.03 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0057  cell wall protein precursor, choline binding protein  29.55 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7951  hypothetical protein  41.44 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2152  hypothetical protein  36.61 
 
 		 178 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.41449 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3901  hypothetical protein  31.71 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0140637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  32.32 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3025  hypothetical protein  41.38 
 
 		 258 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144373  normal  0.932008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1170  hypothetical protein  34.18 
 
 		 280 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379591  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  32.82 
 
 		 1048 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  28.71 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  32.64 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8432  hypothetical protein  33.86 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.774825  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1683  immunogenic secreted protein, putative  45.71 
 
 		 512 aa  56.2  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00328189  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0028  hypothetical protein  29.01 
 
 		 280 aa  53.9  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  27.93 
 
 		 383 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1286  Tn5252, Orf28  36.17 
 
 		 933 aa  53.1  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0939  surface antigen  57.14 
 
 		 449 aa  52.8  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0047  CHAP domain containing protein  35.87 
 
 		 263 aa  52.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.117415  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0422  LysM domain-containing protein  36.17 
 
 		 266 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.48 
 
 		 391 aa  50.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1430  cell wall hydrolase  39.78 
 
 		 397 aa  50.4  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0642  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  36.36 
 
 		 386 aa  49.3  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1033  surface antigen  45.61 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.6 
 
 		 655 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2668  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.6 
 
 		 619 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.6 
 
 		 619 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  29.84 
 
 		 514 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2380  CHAP domain containing protein  29.17 
 
 		 582 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0017  PcsB protein  46.97 
 
 		 447 aa  44.7  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.228  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1884  secretory antigen precursor SsaA, putative  33.33 
 
 		 157 aa  44.3  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4933  NLP/P60 protein  37.65 
 
 		 986 aa  44.3  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1070  CHAP domain protein  37.88 
 
 		 468 aa  43.9  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.518455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8932  NLP/P60 protein  35.14 
 
 		 367 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00108547  normal  0.263686 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>