24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4277 on replicon NC_008538
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008538  Arth_4277  hypothetical protein  100 
 
 
539 aa  1097    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4502  hypothetical protein  55.42 
 
 
528 aa  542  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.689738  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4215  hypothetical protein  53.6 
 
 
518 aa  538  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4559  hypothetical protein  56.07 
 
 
485 aa  530  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.168528 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4943  hypothetical protein  40.66 
 
 
624 aa  340  5e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5522  hypothetical protein  39.09 
 
 
516 aa  322  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349353  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0368  ATPase  39.31 
 
 
532 aa  321  3e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0513969  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5435  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  28.79 
 
 
515 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8941  hypothetical protein  27.68 
 
 
505 aa  150  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57395  normal  0.334134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2362  hypothetical protein  43.65 
 
 
144 aa  113  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.342043  normal  0.319216 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1572  ATP-binding protein  24.95 
 
 
496 aa  98.2  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4709  hypothetical protein  25.05 
 
 
511 aa  93.2  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0831911  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0034  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  23.93 
 
 
711 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0687  ATP-binding protein  26.92 
 
 
502 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7298  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.88 
 
 
696 aa  87.4  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  0.0433123 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2243  ATP-binding protein  25.28 
 
 
512 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06480  type IV secretory pathway VirB4 component-like protein  24.58 
 
 
500 aa  84  0.000000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132231  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0805  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.66 
 
 
495 aa  75.1  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00150  hypothetical protein  26.18 
 
 
495 aa  73.9  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06770  hypothetical protein  25.89 
 
 
495 aa  69.7  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1342  ATP-binding protein  25.32 
 
 
461 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  31.73 
 
 
659 aa  45.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0444  hypothetical protein  25.29 
 
 
509 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3127  hypothetical protein  19.72 
 
 
610 aa  44.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>