More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4244 on replicon NC_008539
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008539  Arth_4244  resolvase  100 
 
 
203 aa  408  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6376  resolvase domain-containing protein  52.94 
 
 
206 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  37.1 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  37.43 
 
 
197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  39.04 
 
 
192 aa  124  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  40.84 
 
 
206 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  37.31 
 
 
204 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  37.31 
 
 
204 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  37.31 
 
 
204 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  37.82 
 
 
193 aa  121  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  38.34 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  39.04 
 
 
197 aa  119  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  38.66 
 
 
194 aa  119  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  39.04 
 
 
197 aa  119  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  39.78 
 
 
209 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  40.24 
 
 
176 aa  118  7e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  38.17 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  35 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  39.13 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  38.1 
 
 
181 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  39.36 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  35.11 
 
 
199 aa  115  5e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  39.25 
 
 
193 aa  115  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  37.82 
 
 
204 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  35.42 
 
 
201 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  37.82 
 
 
204 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  35.6 
 
 
191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0073  resolvase  40.64 
 
 
184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0219  DNA-invertase hin  40.11 
 
 
184 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0242276 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  32.98 
 
 
184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  35.98 
 
 
219 aa  112  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  38.17 
 
 
196 aa  111  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  36.9 
 
 
181 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  37.37 
 
 
196 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  33.51 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  36.27 
 
 
196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  35.29 
 
 
183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  37.37 
 
 
195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  32.45 
 
 
190 aa  109  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  33.16 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  37.23 
 
 
206 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  36.96 
 
 
188 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  32.97 
 
 
218 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  37.63 
 
 
201 aa  107  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  35.75 
 
 
196 aa  107  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  38.07 
 
 
188 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  35.26 
 
 
210 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  36.51 
 
 
186 aa  107  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  37.44 
 
 
193 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  36.36 
 
 
184 aa  107  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  37.31 
 
 
198 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  36.92 
 
 
185 aa  106  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  36.92 
 
 
185 aa  105  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  41.51 
 
 
191 aa  105  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  35.94 
 
 
215 aa  105  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  35.42 
 
 
201 aa  105  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  41.51 
 
 
191 aa  105  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  36.41 
 
 
188 aa  105  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  35.29 
 
 
183 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  35.29 
 
 
183 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  35.14 
 
 
184 aa  104  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  35.11 
 
 
183 aa  104  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  35.29 
 
 
188 aa  104  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  35.83 
 
 
189 aa  104  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0585  resolvase-like protein  40.43 
 
 
189 aa  104  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.698292  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  32.09 
 
 
189 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3655  Resolvase domain protein  37.1 
 
 
212 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0554731  normal  0.301287 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  33.51 
 
 
184 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  34.57 
 
 
185 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  36.7 
 
 
185 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  35.71 
 
 
188 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  35.08 
 
 
194 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  40.96 
 
 
190 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  33.51 
 
 
182 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  37.36 
 
 
209 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  36.02 
 
 
198 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  35.41 
 
 
307 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  35.41 
 
 
307 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  33.87 
 
 
188 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  33.68 
 
 
205 aa  102  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  33.16 
 
 
191 aa  102  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  37.24 
 
 
309 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  35.71 
 
 
187 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  35.71 
 
 
190 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  35.45 
 
 
185 aa  101  6e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  33.51 
 
 
188 aa  102  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  36.92 
 
 
185 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  38.12 
 
 
194 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  38.12 
 
 
194 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  36.32 
 
 
188 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  32.09 
 
 
189 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  30.69 
 
 
235 aa  99.8  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  36.7 
 
 
203 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4931  resolvase domain-containing protein  37.88 
 
 
208 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107506  normal  0.566204 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  33.69 
 
 
180 aa  99.4  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3572  Resolvase domain protein  36.9 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000252709  hitchhiker  0.00189094 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
194 aa  99.4  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  36.07 
 
 
189 aa  99  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3660  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 
202 aa  99  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  34.21 
 
 
200 aa  99  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>