More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4143 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_4143  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  450  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2008  GntR family transcriptional regulator  55.76 
 
 		 232 aa  231  6e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2935  transcriptional regulator, GntR family  46.38 
 
 		 223 aa  152  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000424024  hitchhiker  0.000467948 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0561  transcriptional regulator, GntR family  42.47 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.818378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2145  transcriptional regulator, GntR family  39.9 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3559  transcriptional regulator, GntR family  38.16 
 
 		 232 aa  123  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0311  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 202 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0628  transcriptional regulator protein  37.24 
 
 		 207 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  34.6 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 233 aa  98.6  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 217 aa  91.7  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  33.5 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2447  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3959  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.426708  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  27.83 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3515  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal  0.6161 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0874  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3215  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 242 aa  72  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4601  transcriptional regulator, GntR family  32.38 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100145 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5027  transcriptional regulator, GntR family  27.1 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0178  transcriptional regulator, GntR family  26.61 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5735  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419462 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  27.83 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  30.15 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0537  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0745569  normal  0.0258493 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0495  transcriptional regulator GntR  27.1 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0665  transcriptional regulator, GntR family  26.79 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1517  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3518  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 219 aa  67  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 213 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31590  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  27.06 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7368  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1711  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.968918  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2110  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.123928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  25.59 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2798  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  27.54 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2173  hypothetical protein  24.4 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421026  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  29.5 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  28.23 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6333  transcriptional regulator, GntR family  28.16 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1988  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0497005  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  29.7 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  26.61 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2825  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0997376 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 219 aa  62  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 231 aa  62  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 267 aa  62  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  25.85 
 
 		 221 aa  62  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 230 aa  62  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 234 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0318  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2823  GntR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.346929  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  26.02 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0048  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>