More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4082 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3858  major facilitator superfamily MFS_1  91.57 
 
 		 439 aa  805    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4082  major facilitator transporter  100 
 
 		 439 aa  870    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2329  major facilitator superfamily MFS_1  71.97 
 
 		 452 aa  602  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126091  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5092  major facilitator superfamily MFS_1  52.06 
 
 		 493 aa  455  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  54.5 
 
 		 453 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0117  major facilitator superfamily MFS_1  53.24 
 
 		 444 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  47.82 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3484  major facilitator transporter  47.32 
 
 		 468 aa  382  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3499  major facilitator transporter  46.55 
 
 		 442 aa  378  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3319  major facilitator superfamily MFS_1  44.96 
 
 		 469 aa  350  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4438  major facilitator transporter  45.23 
 
 		 464 aa  350  3e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357208  normal  0.925745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2553  major facilitator family transporter  42.39 
 
 		 457 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0427116  decreased coverage  0.00798136 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4303  major facilitator superfamily MFS_1  44.09 
 
 		 461 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.625349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4413  major facilitator superfamily MFS_1  44.09 
 
 		 461 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.906196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3162  major facilitator transporter  42.39 
 
 		 457 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.688084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3363  major facilitator transporter  43.02 
 
 		 457 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124155  normal  0.451531 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0634  major facilitator transporter  43.85 
 
 		 461 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2224  major facilitator transporter  42.33 
 
 		 457 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0671964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0190  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  42.19 
 
 		 459 aa  331  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 		 477 aa  329  6e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5797  major facilitator transporter  42.06 
 
 		 477 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6411  major facilitator transporter  42.05 
 
 		 461 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0121  major facilitator superfamily MFS_1  44.73 
 
 		 468 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4754  major facilitator transporter  44.19 
 
 		 467 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5816  major facilitator superfamily MFS_1  41.36 
 
 		 468 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5800  major facilitator superfamily MFS_1  41.82 
 
 		 477 aa  317  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000483558  normal  0.391929 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2248  major facilitator superfamily MFS_1  43.74 
 
 		 463 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169754  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  38.08 
 
 		 450 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0102  major facilitator superfamily MFS_1  40.48 
 
 		 456 aa  288  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  38.88 
 
 		 446 aa  285  9e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  38.9 
 
 		 447 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  40.78 
 
 		 441 aa  278  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  38.7 
 
 		 450 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  37.02 
 
 		 461 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2371  major facilitator transporter  40.31 
 
 		 406 aa  273  6e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.363547  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  37.02 
 
 		 461 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  37.02 
 
 		 461 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  37.62 
 
 		 433 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  37.62 
 
 		 433 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  37.62 
 
 		 433 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  37.38 
 
 		 433 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  37.14 
 
 		 433 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  40.94 
 
 		 432 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  40.94 
 
 		 432 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  40.94 
 
 		 432 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  38.8 
 
 		 461 aa  263  4e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  33.86 
 
 		 458 aa  259  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  36 
 
 		 484 aa  254  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  34.3 
 
 		 459 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  39.38 
 
 		 442 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  36.59 
 
 		 459 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  35.01 
 
 		 450 aa  250  3e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  35.25 
 
 		 456 aa  249  9e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  40.79 
 
 		 435 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  37.07 
 
 		 459 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  35.82 
 
 		 447 aa  247  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  34.65 
 
 		 460 aa  247  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  35.32 
 
 		 438 aa  245  9e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.32 
 
 		 437 aa  245  9e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  35.24 
 
 		 455 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  35.52 
 
 		 460 aa  245  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  33.33 
 
 		 430 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  35.09 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.09 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  35.09 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  35.76 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  35.8 
 
 		 437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  34.98 
 
 		 437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  34.71 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  35.09 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  38.36 
 
 		 430 aa  243  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 		 440 aa  244  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  35.32 
 
 		 438 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 445 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  38.94 
 
 		 439 aa  243  6e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 445 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  34.78 
 
 		 437 aa  243  7e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  37.3 
 
 		 443 aa  243  7e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 445 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 465 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  39.01 
 
 		 439 aa  242  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  39.55 
 
 		 451 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 		 461 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 460 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  37.3 
 
 		 445 aa  240  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  38.54 
 
 		 438 aa  239  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  34.09 
 
 		 459 aa  239  5.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 439 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  36.77 
 
 		 460 aa  239  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 435 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 435 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0216  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 		 449 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 435 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1346  major facilitator superfamily MFS_1  37.24 
 
 		 472 aa  237  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63119  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  36.78 
 
 		 446 aa  237  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0241  major facilitator family transporter  36.34 
 
 		 524 aa  237  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  35.73 
 
 		 444 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  35.73 
 
 		 444 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  35.73 
 
 		 444 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  35.73 
 
 		 444 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>