44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4048 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_4048  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  698    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3840  hypothetical protein  72.73 
 
 		 376 aa  462  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0517  hypothetical protein  38.67 
 
 		 363 aa  197  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30590  hypothetical protein  35.31 
 
 		 369 aa  157  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0290  hypothetical protein  35.57 
 
 		 351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3199  hypothetical protein  37.31 
 
 		 345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4168  hypothetical protein  27.65 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2959  hypothetical protein  26.91 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1227  hypothetical protein  40.52 
 
 		 534 aa  79.7  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2501  hypothetical protein  26.87 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0697497  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3511  hypothetical protein  35.92 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1033  hypothetical protein  25.15 
 
 		 367 aa  72  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1110  hypothetical protein  39.82 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1987  putative integral membrane protein  40 
 
 		 552 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285044  hitchhiker  0.000714658 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0067  hypothetical protein  25.22 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2789  hypothetical protein  25.15 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1387  hypothetical protein  31.91 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2812  hypothetical protein  27.19 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0873158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3567  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  31.75 
 
 		 746 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2548  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  32.59 
 
 		 691 aa  57.4  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.678112 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26710  hypothetical protein  38.33 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.79 
 
 		 746 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.61 
 
 		 719 aa  53.9  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2709  membrane protein-like protein  32.28 
 
 		 631 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399622  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0661  hypothetical protein  27.91 
 
 		 361 aa  51.2  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.238233  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0582  hypothetical protein  27.91 
 
 		 361 aa  51.2  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.43804  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1375  hypothetical protein  29.13 
 
 		 361 aa  50.8  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6606  hypothetical protein  30.72 
 
 		 638 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213555  normal  0.251214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2315  hypothetical protein  34.51 
 
 		 609 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2655  hypothetical protein  23.88 
 
 		 650 aa  49.3  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0149  hypothetical protein  25.33 
 
 		 375 aa  49.3  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1493  hypothetical protein  27.63 
 
 		 632 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00418774  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1282  hypothetical protein  26.01 
 
 		 632 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481957  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2586  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  34.52 
 
 		 651 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2534  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  34.52 
 
 		 651 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2587  hypothetical protein  31.01 
 
 		 638 aa  46.6  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.121215 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5820  membrane protein-like protein  31.37 
 
 		 659 aa  46.2  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202056  normal  0.271534 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2067  hypothetical protein  33.33 
 
 		 638 aa  45.8  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012683  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.77 
 
 		 730 aa  45.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0138  hypothetical protein  25.93 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0479408  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1312  hypothetical protein  36.52 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2243  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  31.62 
 
 		 768 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  hitchhiker  0.00000657541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.32 
 
 		 746 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1365  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  30.91 
 
 		 744 aa  43.5  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298227 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>