More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3990 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3990  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
216 aa  417  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3769  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  75.12 
 
 
215 aa  296  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0182  amino acid transporter LysE  46.83 
 
 
205 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7985  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.63 
 
 
209 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46450  Transporter, LysE family  42.03 
 
 
205 aa  138  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3736  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.44 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3513  lysine exporter protein LysE/YggA  41.46 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0702628  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3659  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 
233 aa  125  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0428  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.2 
 
 
204 aa  122  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2077  lysine exporter protein LysE/YggA  42.71 
 
 
204 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3653  amino acid transporter LysE  41.75 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0070  lysine exporter protein LysE/YggA  40.67 
 
 
207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2254  lysine exporter protein LysE/YggA  40.78 
 
 
204 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.675856 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2250  lysine exporter protein LysE/YggA  42 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.233575  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  32.09 
 
 
211 aa  90.1  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  31.13 
 
 
217 aa  89.7  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  35.35 
 
 
204 aa  89  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  30.84 
 
 
231 aa  88.6  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  35.35 
 
 
204 aa  88.6  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  35.35 
 
 
204 aa  88.6  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  36.32 
 
 
203 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  34.85 
 
 
204 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  37.2 
 
 
194 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  37.2 
 
 
194 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  37.2 
 
 
194 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  37.2 
 
 
194 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  34.17 
 
 
204 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.38 
 
 
209 aa  85.5  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  32.07 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  30.48 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 
204 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  30.43 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  34.5 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.32 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  34.12 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  34.78 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0589  lysine exporter protein LysE/YggA  32 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332846  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1345  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.02 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123136  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  32.66 
 
 
204 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0971  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.53 
 
 
211 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.73 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  32.63 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  29.19 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0849  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.03 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1714  lysine exporter protein LysE/YggA  31.6 
 
 
238 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  38.66 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  35.37 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  26.21 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  38.97 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.17 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  32.54 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.16 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.5 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  35.63 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.94 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  34.34 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  28.44 
 
 
213 aa  74.7  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1727  leucine export protein LeuE  33.33 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.859689 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0088  lysine exporter protein LysE/YggA  32.85 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2805  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164797  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6543  lysine exporter protein LysE/YggA  33.9 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  30.98 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4114  amino acid efflux pump, RhtB family protein  34 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.69 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.45744 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0074  LysE family amino acid efflux protein  32.85 
 
 
274 aa  72  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4218  L-lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.93 
 
 
212 aa  72  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.84 
 
 
208 aa  72  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  36.3 
 
 
212 aa  72  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  35.06 
 
 
210 aa  72  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  31.55 
 
 
206 aa  72  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  35.06 
 
 
210 aa  72  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.38 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  32.8 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  32.71 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  30.73 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.94 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  29.38 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  29.38 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.38 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.38 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.28 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.38 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1462  lysine exporter protein LysE/YggA  32.89 
 
 
216 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  32.12 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0145  lysine exporter protein LysE/YggA  35.35 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.38 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  32.34 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  29.38 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  33.64 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  25.24 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>