More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3948 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3948  aldo/keto reductase  100 
 
 
357 aa  721    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0477  aldo/keto reductase  85.99 
 
 
348 aa  593  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  56.2 
 
 
343 aa  366  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  51.41 
 
 
341 aa  343  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  53.09 
 
 
343 aa  341  9e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  53.69 
 
 
342 aa  341  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  52.84 
 
 
340 aa  339  5e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  49.01 
 
 
344 aa  316  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0266  aldo/keto reductase  48.59 
 
 
344 aa  311  9e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  46.76 
 
 
349 aa  306  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  49.27 
 
 
345 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  47.89 
 
 
341 aa  303  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  45.61 
 
 
339 aa  299  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  44.92 
 
 
343 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  47.25 
 
 
344 aa  286  5e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  47.81 
 
 
368 aa  283  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  46.7 
 
 
344 aa  282  6.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  45.87 
 
 
339 aa  278  9e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  45.87 
 
 
339 aa  278  9e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  44.13 
 
 
349 aa  277  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  45.58 
 
 
339 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  47.31 
 
 
341 aa  277  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  46.78 
 
 
345 aa  273  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0928  aldo/keto reductase  43.9 
 
 
339 aa  259  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339617  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  41.78 
 
 
348 aa  258  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  40.53 
 
 
333 aa  229  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
333 aa  227  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  41.21 
 
 
341 aa  226  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  39.83 
 
 
338 aa  211  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  40.85 
 
 
313 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  41.52 
 
 
309 aa  202  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0931  putative oxidoreductase (aldo/keto reductase)  38.91 
 
 
336 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5659  aldo/keto reductase  36.69 
 
 
353 aa  202  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184034  normal  0.516333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  38.33 
 
 
332 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6154  aldo/keto reductase  40.61 
 
 
316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.775736  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7188  aldo/keto reductase  37.46 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2297  aldo/keto reductase  39.82 
 
 
339 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0919281  normal  0.745376 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  38.92 
 
 
333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  40.3 
 
 
325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  37.95 
 
 
335 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  37.43 
 
 
335 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2915  aldo/keto reductase  38.86 
 
 
337 aa  199  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_003296  RS03071  putative oxidoreductase protein  39.64 
 
 
334 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3824  aldo/keto reductase  39.76 
 
 
339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  38.01 
 
 
358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  38.01 
 
 
333 aa  197  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3310  aldo/keto reductase  38.01 
 
 
332 aa  195  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108449  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1898  aldo/keto reductase  35.93 
 
 
332 aa  195  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2653  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  37.75 
 
 
332 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.481202  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  39.33 
 
 
313 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  39.49 
 
 
349 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1755  aldo/keto reductase  38.94 
 
 
323 aa  193  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000557671 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  37.92 
 
 
352 aa  193  4e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2569  aldo/keto reductase  37.24 
 
 
359 aa  193  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  38.53 
 
 
344 aa  192  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3006  aldo/keto reductase  35.28 
 
 
327 aa  192  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.378905 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4281  aldo/keto reductase  38.2 
 
 
317 aa  192  8e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198466  hitchhiker  0.0048015 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  37.31 
 
 
349 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  37.92 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0069  aldo/keto reductase  38.42 
 
 
323 aa  190  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  37.92 
 
 
350 aa  189  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4305  aldo/keto reductase  37 
 
 
342 aa  189  8e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0836372  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0520  aldo/keto reductase  38.74 
 
 
335 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00146659  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4777  aldo/keto reductase  38.19 
 
 
321 aa  188  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  36.28 
 
 
332 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  38.04 
 
 
351 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4075  aldo/keto reductase  37 
 
 
342 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0410  aldo/keto reductase  37.91 
 
 
320 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213987  normal  0.0921299 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3542  aldo/keto reductase  37.5 
 
 
332 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4151  aldo/keto reductase  37 
 
 
342 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  38.04 
 
 
351 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  38.04 
 
 
351 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  37.11 
 
 
349 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  39.12 
 
 
343 aa  186  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3286  aldo/keto reductase  38.87 
 
 
323 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0458  aldo/keto reductase  39.23 
 
 
317 aa  186  5e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2932  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  37.91 
 
 
335 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0453646  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1691  aldo/keto reductase  39.17 
 
 
336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0210969 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  35.54 
 
 
361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  38.53 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  36.62 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  36.62 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1811  aldo/keto reductase  32.93 
 
 
316 aa  184  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  36.95 
 
 
343 aa  183  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  33.94 
 
 
315 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  35.05 
 
 
352 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1656  aldo/keto reductase  37.05 
 
 
328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.702563 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  36 
 
 
345 aa  183  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  36.66 
 
 
334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  36.61 
 
 
354 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  36.98 
 
 
353 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4156  aldo/keto reductase  37.46 
 
 
335 aa  182  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0249282  normal  0.138418 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  32.38 
 
 
323 aa  182  6e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2751  aldo/keto family dehydrogenase  39.33 
 
 
329 aa  182  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178849 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  35.08 
 
 
339 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  35.08 
 
 
339 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  36.89 
 
 
370 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  36.81 
 
 
345 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  37.18 
 
 
351 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>