49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3940 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3738  putative ATP-binding protein  86.98 
 
 
1153 aa  2024    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3940  putative ATP-binding protein  100 
 
 
1154 aa  2336    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  29.68 
 
 
1120 aa  355  4e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  28.09 
 
 
1124 aa  350  6e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0868  hypothetical protein  27.24 
 
 
1137 aa  350  9e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  29.41 
 
 
1126 aa  348  3e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  30.09 
 
 
1118 aa  331  5.0000000000000004e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  28.16 
 
 
1128 aa  331  6e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  29.21 
 
 
1143 aa  328  5e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  27.07 
 
 
1136 aa  286  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  27.4 
 
 
1140 aa  267  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  27.94 
 
 
1120 aa  263  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  25.6 
 
 
1121 aa  251  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  26.31 
 
 
1125 aa  248  4.9999999999999997e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  25.33 
 
 
1121 aa  248  6e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  25.19 
 
 
1126 aa  245  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  26.17 
 
 
1125 aa  245  3.9999999999999997e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  24.21 
 
 
1122 aa  238  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  26.83 
 
 
1114 aa  238  5.0000000000000005e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  27.62 
 
 
1125 aa  236  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  26.88 
 
 
1146 aa  234  5e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  24.62 
 
 
1121 aa  234  6e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  25.09 
 
 
1121 aa  234  1e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  24.96 
 
 
1120 aa  233  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  25.04 
 
 
1130 aa  231  8e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  25.24 
 
 
1121 aa  230  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  25.3 
 
 
1120 aa  229  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  25.3 
 
 
1120 aa  229  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  25.47 
 
 
1118 aa  229  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  25.02 
 
 
1166 aa  226  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  23.96 
 
 
1121 aa  226  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  25.68 
 
 
1151 aa  221  3.9999999999999997e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  24.41 
 
 
1123 aa  213  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  24.96 
 
 
1124 aa  209  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  23.43 
 
 
1144 aa  209  3e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  23.67 
 
 
1143 aa  207  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  25.14 
 
 
1133 aa  195  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  23.09 
 
 
1133 aa  177  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0424  hypothetical protein  24.13 
 
 
1181 aa  175  5e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.924929  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  25.18 
 
 
1045 aa  170  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3697  hypothetical protein  27.79 
 
 
694 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000334148 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  23.25 
 
 
979 aa  147  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0741  hypothetical protein  31.67 
 
 
352 aa  100  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0875  hypothetical protein  27.24 
 
 
462 aa  89.4  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3696  hypothetical protein  26.46 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000237881 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  34.03 
 
 
1113 aa  55.8  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0979  MukB N- domain/M protein repeat protein  25.65 
 
 
1107 aa  52.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.653871  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  26.29 
 
 
1093 aa  51.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0670  chromosome segregation ATPase-like protein  28.5 
 
 
1159 aa  48.1  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>