113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3928 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3928  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  100 
 
 
210 aa  414  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  55.19 
 
 
215 aa  216  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  50.72 
 
 
209 aa  180  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00440  predicted dinucleotide-binding enzyme  41.15 
 
 
190 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30391  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2052  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  45.13 
 
 
191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3530  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  43.3 
 
 
222 aa  135  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.488676 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2654  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  43.54 
 
 
190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0944  dinucleotide-binding protein  40.7 
 
 
188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5762  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  43.6 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.904394 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1098  putative reductase  44.38 
 
 
209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0151402 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1722  dinucleotide-binding protein  38.94 
 
 
190 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0135732  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3738  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  42.25 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.152483  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3613  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  39.07 
 
 
205 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  40.64 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2952  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  38.8 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05455  putative transmemembrane reductase oxidoreductase protein  36.98 
 
 
208 aa  91.7  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0971515 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3941  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  35.78 
 
 
205 aa  91.3  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2534  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  36.61 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0788  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  36.32 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0970  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  34.78 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.930985  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0892  NADPH-dependent F420 reductase  34.43 
 
 
222 aa  79  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3114  NADPH-dependent F420 reductase  33.81 
 
 
226 aa  79  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00100508  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3532  dinucleotide-binding protein-like protein  42.48 
 
 
132 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7106  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.84 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693363  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2893  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.72 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3483  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  34.16 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2069  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.41 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4409  NADPH-dependent F420 reductase  34.91 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.614636  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0243  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  37.97 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3343  NADPH-dependent F420 reductase  32.98 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904937  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3207  NADPH-dependent F420 reductase  32.45 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63362  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5227  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.88 
 
 
198 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308385  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1119  NADPH-dependent F420 reductase  30.95 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2205  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.64 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302073  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1248  NADPH-dependent F420 reductase  32.61 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.0614731 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0864  NADPH-dependent F420 reductase  29.85 
 
 
223 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0626  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.73 
 
 
225 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8069  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.17 
 
 
216 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.24 
 
 
316 aa  62.4  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1120  NADPH-dependent F420 reductase  30.54 
 
 
223 aa  62.8  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0076  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.32 
 
 
221 aa  61.6  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.685757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2407  hypothetical protein  32.81 
 
 
214 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4256  NADPH-dependent F420 reductase  31.22 
 
 
226 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2310  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.73 
 
 
230 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.07 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3964  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.54 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1646  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.28 
 
 
229 aa  60.5  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4044  NADPH-dependent F420 reductase  30.14 
 
 
225 aa  59.7  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0414  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.79 
 
 
248 aa  59.7  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167555  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5114  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.18 
 
 
199 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.581328  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2584  NADPH-dependent f420 reductase  32.98 
 
 
221 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.16433 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1414  NADPH-dependent F420 reductase  29.47 
 
 
225 aa  58.9  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0125  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.18 
 
 
216 aa  58.5  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1199  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.27 
 
 
212 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.52333  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1230  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.84 
 
 
286 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0940  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.77 
 
 
215 aa  57.4  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4039  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.46 
 
 
219 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0594084 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1370  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.41 
 
 
239 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.77619  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  26.63 
 
 
236 aa  55.5  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0062  NADPH-dependent F420 reductase  33.33 
 
 
244 aa  55.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3589  NADPH-dependent F420 reductase  33.51 
 
 
232 aa  55.5  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000495197 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3403  NADPH-dependent F420 reductase  31.88 
 
 
231 aa  55.5  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0026  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  27.36 
 
 
223 aa  55.1  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0190951  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1258  NADPH-dependent F420 reductase  25.74 
 
 
222 aa  54.7  0.0000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.826887  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2198  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.77 
 
 
257 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2055  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.14 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168679  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1974  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.86 
 
 
242 aa  53.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3805  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.34 
 
 
203 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40299  normal  0.215809 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1508  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  35.64 
 
 
198 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0447  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.55 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481613  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0864  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.81 
 
 
222 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1400  NADPH-dependent F420 reductase  28.42 
 
 
226 aa  53.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3151  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  28.76 
 
 
243 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2111  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.96 
 
 
240 aa  52.8  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3176  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.98 
 
 
236 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0741  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32 
 
 
228 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2131  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.57 
 
 
219 aa  52  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4570  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.68 
 
 
199 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31010  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  29.83 
 
 
200 aa  51.6  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1950  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.05 
 
 
203 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3140  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.32 
 
 
244 aa  50.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2073  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.13 
 
 
200 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2670  hypothetical protein  35.19 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3534  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  38.83 
 
 
222 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.11 
 
 
248 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0265  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.13 
 
 
270 aa  49.3  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6559  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.33 
 
 
202 aa  49.3  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0613  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.76 
 
 
226 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.356335  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1760  NADPH-dependent F420 reductase  29.38 
 
 
227 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.00319562 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3174  NADPH-dependent F420 reductase  25 
 
 
216 aa  48.5  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2931  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.02 
 
 
209 aa  48.5  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1562  NADPH-dependent F420 reductase  38.04 
 
 
222 aa  48.1  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36320  predicted dinucleotide-binding enzyme  27.32 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2808  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.08 
 
 
259 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2768  NADPH-dependent F420 reductase  28.5 
 
 
226 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7403  hypothetical protein  29.94 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0816  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.86 
 
 
229 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.428849  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1025  NADPH-dependent F420 reductase  29.61 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4020  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.42 
 
 
208 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4463  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.79 
 
 
219 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>