More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3922 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3922  ferric reductase domain-containing protein  100 
 
 
481 aa  957    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3724  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  71.03 
 
 
496 aa  649    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  39.77 
 
 
448 aa  268  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0049  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.16 
 
 
453 aa  250  4e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19928  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0380  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  39.17 
 
 
447 aa  241  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.682576  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6591  ferric reductase domain-containing protein  37.9 
 
 
481 aa  241  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.298176  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  35.97 
 
 
450 aa  239  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.39 
 
 
456 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000201002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0392  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.09 
 
 
469 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.497011 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1301  ferric reductase domain protein transmembrane component  28.54 
 
 
447 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.2 
 
 
419 aa  104  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  24.41 
 
 
447 aa  94.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0901  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.84 
 
 
261 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.19999  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0093  ferric reductase domain-containing protein  28.12 
 
 
419 aa  83.2  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.852722  normal  0.641862 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3009  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.89 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  27.75 
 
 
445 aa  80.1  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40020  Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27.79 
 
 
443 aa  78.2  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  22.52 
 
 
465 aa  77  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.81 
 
 
430 aa  76.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3051  ferric reductase/oxidoreductase, FAD/NAD binding  24.82 
 
 
441 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0321  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.05 
 
 
444 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.618746  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1926  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  25.5 
 
 
446 aa  71.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.956318  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0310  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.57 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109576  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0090  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.34 
 
 
494 aa  70.9  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3123  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  23.86 
 
 
445 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2519  oxidoreductase FAD-binding region  27.13 
 
 
350 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0785  ferric reductase domain-containing protein  24.42 
 
 
447 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.984376  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2334  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.94 
 
 
658 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0217317  normal  0.528208 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3236  xylene monooxygenase electron transfer component  26.84 
 
 
232 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150181  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.77 
 
 
465 aa  68.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2715  ferric reductase domain-containing protein  29.74 
 
 
447 aa  67.8  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131966  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3017  ferric reductase-like transmembrane component-like  29.74 
 
 
447 aa  67.8  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812063  hitchhiker  0.00768092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0748  Ferric reductase domain protein transmembrane component  24.42 
 
 
447 aa  67.4  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1381  ferric reductase-like  22.64 
 
 
307 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000207165  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2942  flavodoxin oxidoreductase precursor  23.88 
 
 
444 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03005  Phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  24.19 
 
 
349 aa  65.9  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.08 
 
 
232 aa  63.9  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  31.17 
 
 
316 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0075  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  25.97 
 
 
446 aa  63.5  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.704338  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3093  ferric reductase domain-containing protein  26.32 
 
 
443 aa  62.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.86 
 
 
669 aa  63.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  34.19 
 
 
316 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0648  hypothetical protein  26.46 
 
 
434 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  25.91 
 
 
625 aa  62.4  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4465  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.11 
 
 
699 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.89 
 
 
681 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.74 
 
 
765 aa  62.4  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3322  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.72 
 
 
691 aa  61.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.138588 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0489  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  26.52 
 
 
445 aa  61.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4699  ferredoxin  27.52 
 
 
385 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148299  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3517  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.16 
 
 
346 aa  59.7  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.611569  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2762  ferric reductase-like transmembrane component-like  25.32 
 
 
464 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632211  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.6 
 
 
232 aa  59.7  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000975827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07070  hypothetical protein  25.94 
 
 
434 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0316  ferric reductase-like transmembrane component-like  28.64 
 
 
444 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1329  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.98 
 
 
277 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1689  nitric oxide dioxygenase  30.2 
 
 
402 aa  58.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  26.03 
 
 
627 aa  58.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  30.65 
 
 
395 aa  58.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0044  nitric oxide dioxygenase  25.47 
 
 
397 aa  58.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.534216  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2474  ferric reductase domain-containing protein  27.51 
 
 
446 aa  58.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000153694 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23260  flavodoxin reductase family protein  31.09 
 
 
375 aa  58.2  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.405021  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2541  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  26.6 
 
 
406 aa  58.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4085  ferric reductase domain-containing protein  38.55 
 
 
489 aa  58.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0882  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.27 
 
 
283 aa  57.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.256079 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1200  methane monooxygenase, C subunit  25.46 
 
 
348 aa  57.4  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1216  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  24.87 
 
 
420 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0036  nitric oxide dioxygenase  25.47 
 
 
397 aa  57.4  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0192544  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.56 
 
 
702 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0327  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.34 
 
 
295 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.35697 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1923  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  30.46 
 
 
442 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0218525  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.87 
 
 
421 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0569  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.79 
 
 
281 aa  56.2  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  30.2 
 
 
357 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  30 
 
 
403 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1828  putative CDP-6-deoxy-delta-3,4- glucoseen reductase  30.99 
 
 
341 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2788  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.88 
 
 
282 aa  55.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2797  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.88 
 
 
282 aa  55.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0286  anaerobic sulfite reductase subunit B  24.08 
 
 
263 aa  54.7  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1799  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.33 
 
 
336 aa  55.1  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.73 
 
 
678 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5418  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.57 
 
 
684 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.13 
 
 
363 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3574  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.57 
 
 
684 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323016  hitchhiker  0.00626441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1767  ferredoxin  27.68 
 
 
379 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.374649 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2372  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  28.26 
 
 
335 aa  54.7  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1092  globin  27.36 
 
 
395 aa  54.7  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.21 
 
 
345 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1972  oxidoreductase FAD-binding subunit  24.91 
 
 
403 aa  54.3  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  26.56 
 
 
394 aa  54.3  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1462  NADH oxidoreductase, putative  28.93 
 
 
372 aa  53.9  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4133  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.86 
 
 
370 aa  53.9  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.013918  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  27.75 
 
 
356 aa  53.5  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.5 
 
 
336 aa  53.5  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3630  multidomain oxidoreductase  27.49 
 
 
334 aa  53.5  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.06 
 
 
690 aa  53.5  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2110  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.94 
 
 
335 aa  53.1  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0440223  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  29.56 
 
 
332 aa  53.5  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1127  putative oxidoreductase  23.62 
 
 
443 aa  53.1  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000164888  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3715  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.03 
 
 
467 aa  53.5  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>