277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3917 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  42.53 
 
 		 1003 aa  754    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  46.36 
 
 		 992 aa  739    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3719  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  70.95 
 
 		 1004 aa  1431    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3917  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 1020 aa  2049    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  48.32 
 
 		 1003 aa  871    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  48.41 
 
 		 968 aa  793    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26640  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  41.11 
 
 		 996 aa  645    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  45.05 
 
 		 1018 aa  785    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  47.5 
 
 		 992 aa  788    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  38.22 
 
 		 1041 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  36.79 
 
 		 1023 aa  585  1.0000000000000001e-165  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.63 
 
 		 1026 aa  582  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  36.62 
 
 		 1033 aa  575  1.0000000000000001e-162  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  36.56 
 
 		 1063 aa  570  1e-161  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  33.84 
 
 		 1024 aa  566  1e-160  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30036  Beta-galactosidase (Lactase)  33.37 
 
 		 1021 aa  512  1e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0855272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0154  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.24 
 
 		 1030 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  36.79 
 
 		 1020 aa  508  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  33.14 
 
 		 1035 aa  505  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  32.54 
 
 		 1084 aa  502  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0750  beta-galactosidase  31.01 
 
 		 1009 aa  500  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0186034  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  35.27 
 
 		 1044 aa  501  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  32.61 
 
 		 1084 aa  500  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  36.24 
 
 		 1043 aa  495  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03201  beta-galactosidase (Eurofung)  33.84 
 
 		 1030 aa  492  1e-137  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.112028 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0766  beta-galactosidase  30.17 
 
 		 1012 aa  489  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.156765  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  34.36 
 
 		 1028 aa  484  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  31.69 
 
 		 1041 aa  481  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  33.88 
 
 		 1029 aa  482  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  33.59 
 
 		 1024 aa  475  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1768  beta-D-galactosidase  33.88 
 
 		 1043 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.035592  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  32.56 
 
 		 1030 aa  471  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3281  beta-D-galactosidase  33.62 
 
 		 1024 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000245928  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00298  beta-D-galactosidase  33.72 
 
 		 1024 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000026518  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3262  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.72 
 
 		 1024 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000877394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00302  hypothetical protein  33.72 
 
 		 1024 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000375259  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  31.6 
 
 		 1129 aa  465  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  34.41 
 
 		 1094 aa  463  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1362  beta-D-galactosidase  33.09 
 
 		 1043 aa  465  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00215799  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0408  beta-D-galactosidase  33.46 
 
 		 1024 aa  463  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000144327  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0368  beta-D-galactosidase  33.66 
 
 		 1024 aa  466  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000219694  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  31.35 
 
 		 1050 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  31.41 
 
 		 1066 aa  458  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  31.41 
 
 		 1079 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0417  beta-D-galactosidase  33.33 
 
 		 1024 aa  458  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000241482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  31.32 
 
 		 1066 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  31.71 
 
 		 1049 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.21 
 
 		 1013 aa  452  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119488  Beta-galactosidase, putative  31.18 
 
 		 1164 aa  449  1e-125  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873023  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  31.74 
 
 		 1032 aa  452  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2733  beta-D-galactosidase  33.4 
 
 		 1036 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000508239  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  34.43 
 
 		 1008 aa  449  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  33.37 
 
 		 1032 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4390  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  31.24 
 
 		 1030 aa  445  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0625  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.44 
 
 		 1030 aa  443  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  31.34 
 
 		 1030 aa  444  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  30.75 
 
 		 1031 aa  445  1e-123  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  31.44 
 
 		 1030 aa  443  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  31.34 
 
 		 1030 aa  444  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02945  cryptic beta-D-galactosidase, alpha subunit  31.34 
 
 		 1030 aa  442  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02895  hypothetical protein  31.34 
 
 		 1030 aa  442  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  31.31 
 
 		 1030 aa  442  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  31.17 
 
 		 1035 aa  439  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.06 
 
 		 1033 aa  435  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  30.68 
 
 		 1036 aa  432  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  31.99 
 
 		 1077 aa  431  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1366  beta-galactosidase  31.29 
 
 		 1026 aa  429  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.45 
 
 		 1036 aa  428  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  30.47 
 
 		 1455 aa  425  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.64 
 
 		 1264 aa  426  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  31.97 
 
 		 1059 aa  424  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  28.47 
 
 		 1043 aa  422  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  33.15 
 
 		 1076 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.16 
 
 		 1053 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  30.04 
 
 		 1108 aa  412  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  33.82 
 
 		 1012 aa  404  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  28.42 
 
 		 1046 aa  405  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.98 
 
 		 1289 aa  400  9.999999999999999e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  31.02 
 
 		 1045 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  29.26 
 
 		 1019 aa  397  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.16 
 
 		 1005 aa  395  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  29.23 
 
 		 1045 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  30.86 
 
 		 1112 aa  384  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  29.5 
 
 		 1017 aa  378  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0729  beta-galactosidase  30.42 
 
 		 1023 aa  361  4e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0768617  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.69 
 
 		 1329 aa  357  7.999999999999999e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3187  glycoside hydrolase family protein  34.59 
 
 		 1022 aa  337  7e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3257  glycoside hydrolase family protein  35.44 
 
 		 1017 aa  325  4e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2025  glycoside hydrolase family protein  32.38 
 
 		 640 aa  312  2.9999999999999997e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00409776  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0288  glycoside hydrolase family protein  32.59 
 
 		 628 aa  299  2e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000148878  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.15 
 
 		 1424 aa  291  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3832  predicted protein  36.78 
 
 		 349 aa  209  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  28.37 
 
 		 987 aa  184  9.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3909  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.78 
 
 		 1600 aa  177  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  28.92 
 
 		 972 aa  159  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.93 
 
 		 920 aa  154  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.18 
 
 		 920 aa  153  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  23.71 
 
 		 951 aa  151  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  25.36 
 
 		 558 aa  138  6.0000000000000005e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  28.25 
 
 		 603 aa  135  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>