More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3886 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 311 aa  616  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  87.02 
 
 		 303 aa  475  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  52.56 
 
 		 315 aa  252  6e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  41.91 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  41.53 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17190  transcriptional regulator  36.58 
 
 		 308 aa  168  9e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00132066  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  40.87 
 
 		 331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  38.1 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  31.68 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 300 aa  135  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  34.08 
 
 		 333 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  32.66 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  33.73 
 
 		 324 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  30.3 
 
 		 298 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  34.39 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0838  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00258172  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 296 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  33.92 
 
 		 302 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  32.36 
 
 		 301 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  32.3 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 314 aa  122  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  38.33 
 
 		 307 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  31.94 
 
 		 301 aa  122  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1193  transcriptional regulator, LysR family  35.13 
 
 		 347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  39.21 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  32.71 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  32.75 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 300 aa  113  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  30.2 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  30.26 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  31.77 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 305 aa  109  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  29.62 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  33.09 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  28.81 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  34.77 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3401  LysR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  29.52 
 
 		 309 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  30.86 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  31.71 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  30.97 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2541  ArsR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  29.6 
 
 		 327 aa  100  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  33.44 
 
 		 311 aa  99.8  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  28.75 
 
 		 327 aa  99.4  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  28.99 
 
 		 310 aa  99  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  32.89 
 
 		 308 aa  99  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0208  transcriptional regulator, LysR family  29.73 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  29.43 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 		 303 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  31.54 
 
 		 300 aa  97.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  29.25 
 
 		 304 aa  96.3  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  27.46 
 
 		 308 aa  95.9  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  32.52 
 
 		 302 aa  95.9  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  32.21 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 283 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  29.03 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  27.6 
 
 		 302 aa  93.6  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  28.73 
 
 		 288 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  29.64 
 
 		 303 aa  92.8  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  29.96 
 
 		 308 aa  92.4  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4270  transcriptional regulator, LysR family  31.27 
 
 		 321 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3713  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  27.02 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2616  transcriptional regulator, LysR family  31.69 
 
 		 306 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000734486  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0450  LysR substrate-binding protein  42.73 
 
 		 310 aa  86.7  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2544  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 300 aa  86.3  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0984343  normal  0.803064 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  26.69 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  26.69 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  30.8 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  30.03 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8854  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1352  transcriptional regulator, LysR family  28.51 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000043904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4593  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5452  transcriptional regulator, LysR family  25.4 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>