More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3822 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
408 aa  826    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1365  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.08 
 
 
396 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0100837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6905  Glutaryl-CoA dehydrogenase  48.2 
 
 
382 aa  363  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1382  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.47 
 
 
396 aa  363  4e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000229631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3323  Glutaryl-CoA dehydrogenase  47.68 
 
 
454 aa  362  7.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000794594 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01490  Acyl-CoA dehydrogenase  45.36 
 
 
453 aa  353  2.9999999999999997e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5685  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.64 
 
 
452 aa  350  3e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1396  Acyl-CoA dehydrogenase  46.39 
 
 
400 aa  347  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.012547  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1209  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.47 
 
 
453 aa  345  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0098  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.76 
 
 
442 aa  340  4e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0434945  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1221  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  44.96 
 
 
466 aa  338  7e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.395809  normal  0.664246 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3470  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.7 
 
 
395 aa  322  7e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.131363  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0217  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.95 
 
 
403 aa  320  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0223  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.95 
 
 
403 aa  320  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3043  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.56 
 
 
402 aa  316  5e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.942472  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0610  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.86 
 
 
410 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.326898  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0739  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.75 
 
 
411 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3505  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.88 
 
 
393 aa  305  7e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147907  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0871  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.98 
 
 
409 aa  303  5.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.88 
 
 
396 aa  297  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2455  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  41.54 
 
 
398 aa  297  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.19606  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0077  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.81 
 
 
394 aa  286  5e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0434  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.84 
 
 
404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2382  Glutaryl-CoA dehydrogenase  41.86 
 
 
407 aa  281  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0375  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  45.13 
 
 
385 aa  277  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0031  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.56 
 
 
399 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2061  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  43.29 
 
 
404 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1809  Glutaryl-CoA dehydrogenase  41.39 
 
 
395 aa  266  4e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.141566  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19560  acyl-CoA dehydrogenase  42.42 
 
 
400 aa  262  1e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30270  acyl-CoA dehydrogenase  42.05 
 
 
461 aa  257  3e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02900  acyl-CoA dehydrogenase  40.69 
 
 
402 aa  255  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03070  acyl-CoA dehydrogenase  39.85 
 
 
404 aa  254  3e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0987  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.47 
 
 
395 aa  235  9e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0223  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.34 
 
 
414 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2905  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.06 
 
 
387 aa  233  5e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1746  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  35.05 
 
 
401 aa  230  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2578  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.25 
 
 
386 aa  228  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0502  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.9 
 
 
387 aa  228  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1877  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  35.55 
 
 
386 aa  229  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0830  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.92 
 
 
397 aa  228  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.897667  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1408  acyl-CoA dehydrogenase  33.76 
 
 
392 aa  227  3e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.458942  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2387  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  37.85 
 
 
402 aa  227  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.702715  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2522  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.4 
 
 
386 aa  223  4e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2329  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.67 
 
 
396 aa  222  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.480554  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3206  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.92 
 
 
392 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0674188  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1120  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.44 
 
 
408 aa  216  5e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0874  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.55 
 
 
419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04655  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  33.17 
 
 
392 aa  213  3.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1290  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.42 
 
 
393 aa  213  4.9999999999999996e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3055  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.22 
 
 
399 aa  213  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.712311  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2757  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.68 
 
 
396 aa  213  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133725 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1745  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.04 
 
 
393 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0523297  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2075  Acyl-CoA dehydrogenase-like  33.85 
 
 
392 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000570553  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17470  acyl-CoA dehydrogenase  35.73 
 
 
396 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.773993  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2231  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.67 
 
 
392 aa  209  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2761  acyl-CoA dehydrogenase-like  34.15 
 
 
430 aa  208  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.192493  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0517  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.97 
 
 
386 aa  207  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.602895  decreased coverage  0.000687036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.08 
 
 
387 aa  207  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0541  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.82 
 
 
384 aa  207  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0610  acyl-CoA dehydrogenase-like  32.24 
 
 
392 aa  206  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.777279  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0429  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.55 
 
 
386 aa  206  6e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4408  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.35 
 
 
394 aa  206  8e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5749  glutaryl-CoA dehydrogenase  35.44 
 
 
387 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.312995 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0159  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.11 
 
 
397 aa  203  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4513  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.33 
 
 
402 aa  199  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1026  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.5 
 
 
402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3419  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.33 
 
 
394 aa  197  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0350417  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4233  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.35 
 
 
394 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0274104  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1068  glutaryl-CoA dehydrogenase  35.9 
 
 
396 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1436  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.24 
 
 
415 aa  195  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.549354  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04805  acyl-CoA dehydrogenase 1  34.69 
 
 
391 aa  194  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23170  acyl-CoA dehydrogenase  34.58 
 
 
408 aa  194  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.17 
 
 
401 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0419  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.83 
 
 
395 aa  193  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3322  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.51 
 
 
393 aa  193  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3170  glutaryl-CoA dehydrogenase  34.62 
 
 
422 aa  192  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.129371 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5829  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.67 
 
 
395 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.628432  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6742  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.42 
 
 
395 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224399  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9061  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.68 
 
 
385 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1329  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.77 
 
 
389 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4222  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.48 
 
 
389 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0539  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  32.99 
 
 
391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8460  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.02 
 
 
391 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4889  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.14 
 
 
392 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378984  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3367  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.99 
 
 
385 aa  190  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0711  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.16 
 
 
395 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245364  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10405  acyl-CoA dehydrogenase fadE7  32.9 
 
 
395 aa  190  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1284  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.42 
 
 
404 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2979  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.91 
 
 
398 aa  189  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0844  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.62 
 
 
396 aa  189  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.114761 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2407  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.91 
 
 
398 aa  189  8e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1162  Acyl-CoA dehydrogenase-like  32.9 
 
 
404 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0873897  normal  0.0990997 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4292  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.18 
 
 
389 aa  189  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2632  hypothetical protein  34.1 
 
 
385 aa  188  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2502  hypothetical protein  34.1 
 
 
385 aa  188  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3904  putative glutaryl-CoA dehydrogenase  32.64 
 
 
396 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0776  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.64 
 
 
396 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.567358 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2570  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.9 
 
 
395 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.216949  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0694  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.64 
 
 
395 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324229  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2130  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.52 
 
 
394 aa  187  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0270955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>