More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3819 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  100 
 
 
529 aa  1082    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  50.57 
 
 
501 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  47.22 
 
 
503 aa  477  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  49.04 
 
 
509 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  41.97 
 
 
516 aa  385  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  41.15 
 
 
499 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  40.23 
 
 
508 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  39.85 
 
 
508 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  40.42 
 
 
508 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  36.89 
 
 
496 aa  365  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  36.7 
 
 
496 aa  364  3e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  36.31 
 
 
496 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  36.31 
 
 
496 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  41.04 
 
 
518 aa  351  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  42.5 
 
 
517 aa  346  5e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  42.5 
 
 
517 aa  346  5e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  42.5 
 
 
517 aa  346  5e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  42.12 
 
 
520 aa  344  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  39.89 
 
 
512 aa  338  9.999999999999999e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  38.49 
 
 
505 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  39.92 
 
 
515 aa  335  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  36.95 
 
 
513 aa  332  9e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19550  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  38.42 
 
 
533 aa  327  2.0000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  38.97 
 
 
516 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  38.71 
 
 
620 aa  324  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  40.95 
 
 
520 aa  323  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  39.89 
 
 
518 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  41.06 
 
 
526 aa  319  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  39.08 
 
 
518 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  37.8 
 
 
515 aa  317  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  37.12 
 
 
518 aa  317  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  37.64 
 
 
520 aa  316  6e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0047  AMP-dependent synthetase and ligase  37.07 
 
 
517 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  36.75 
 
 
525 aa  315  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  39.2 
 
 
525 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0311  AMP-dependent synthetase and ligase  38.32 
 
 
501 aa  312  7.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0140314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  37.98 
 
 
520 aa  312  7.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  38.43 
 
 
518 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  39.5 
 
 
511 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  37.67 
 
 
521 aa  310  4e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  36.68 
 
 
504 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  38.23 
 
 
530 aa  309  6.999999999999999e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  37.82 
 
 
513 aa  306  6e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  38.55 
 
 
518 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 
512 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  37.18 
 
 
523 aa  305  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5453  AMP-dependent synthetase and ligase  36.52 
 
 
554 aa  303  5.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2524  AMP-dependent synthetase and ligase  36.4 
 
 
520 aa  303  6.000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.82155 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  36.12 
 
 
522 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  35.55 
 
 
503 aa  302  1e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  37.35 
 
 
509 aa  301  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  39.13 
 
 
527 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 
518 aa  297  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0894  acyl-CoA synthetase  37.26 
 
 
520 aa  297  3e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.493906  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  36.42 
 
 
520 aa  296  5e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  36.47 
 
 
540 aa  295  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2351  acyl-CoA synthetase  36.42 
 
 
517 aa  294  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197387  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  38.24 
 
 
551 aa  294  3e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  36.75 
 
 
506 aa  294  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.25 
 
 
526 aa  293  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3129  AMP-dependent synthetase and ligase  38.96 
 
 
534 aa  293  4e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  39.23 
 
 
502 aa  293  6e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  38.61 
 
 
515 aa  293  6e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2654  AMP-dependent synthetase and ligase  36.26 
 
 
587 aa  293  6e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  38.61 
 
 
515 aa  293  6e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  37.93 
 
 
506 aa  293  7e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4810  AMP-dependent synthetase and ligase  39.92 
 
 
528 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672528  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4181  acyl-CoA synthetase  36.38 
 
 
522 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0642  acyl-CoA synthetase  37.4 
 
 
529 aa  291  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.95301  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6078  AMP-dependent synthetase and ligase  40.54 
 
 
553 aa  290  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  36.17 
 
 
526 aa  290  6e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.52 
 
 
526 aa  290  6e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  39.69 
 
 
527 aa  289  7e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.84 
 
 
525 aa  289  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.42 
 
 
492 aa  289  9e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1189  AMP-dependent synthetase and ligase  37.74 
 
 
548 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  38.01 
 
 
519 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1135  AMP-dependent synthetase and ligase  38.65 
 
 
517 aa  287  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.755647  hitchhiker  0.000174804 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 
510 aa  286  5e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.6 
 
 
510 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  36.78 
 
 
662 aa  286  5.999999999999999e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.38 
 
 
490 aa  286  7e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.29 
 
 
519 aa  286  7e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  37.9 
 
 
515 aa  286  8e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.79 
 
 
514 aa  286  8e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.87 
 
 
530 aa  286  8e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  36.33 
 
 
510 aa  286  9e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.4 
 
 
510 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33 
 
 
510 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 
539 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33 
 
 
510 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33 
 
 
510 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 
510 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33 
 
 
510 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33 
 
 
510 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33 
 
 
510 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1747  AMP-dependent synthetase and ligase  37.6 
 
 
561 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  35.54 
 
 
566 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.19 
 
 
486 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1402  AMP-dependent synthetase and ligase  36.31 
 
 
532 aa  283  6.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>