More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3722 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
206 aa  421  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  83.01 
 
 
206 aa  353  7.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  63.45 
 
 
202 aa  256  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  60.77 
 
 
218 aa  254  4e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4760  beta-lactamase domain protein  61.69 
 
 
202 aa  252  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  60.91 
 
 
208 aa  251  7e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  56.72 
 
 
209 aa  243  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  57.79 
 
 
210 aa  243  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  63.18 
 
 
207 aa  242  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  60.8 
 
 
205 aa  241  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  55.67 
 
 
204 aa  240  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  59.59 
 
 
209 aa  236  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  58.38 
 
 
208 aa  236  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2886  beta-lactamase domain protein  59.18 
 
 
220 aa  235  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  59.39 
 
 
211 aa  233  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  59.07 
 
 
209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  55.94 
 
 
204 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  57.51 
 
 
210 aa  231  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  57.51 
 
 
210 aa  231  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  57.51 
 
 
210 aa  231  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  54.46 
 
 
210 aa  229  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  58.67 
 
 
216 aa  227  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  57.44 
 
 
215 aa  224  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  55.15 
 
 
574 aa  222  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  54.19 
 
 
205 aa  220  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  53.2 
 
 
208 aa  218  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  54.36 
 
 
228 aa  218  6e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  54.27 
 
 
207 aa  213  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  51.92 
 
 
213 aa  206  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  52.79 
 
 
211 aa  205  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2999  beta-lactamase domain-containing protein  42.56 
 
 
235 aa  155  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.658581 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2551  putative hydrolase  41.58 
 
 
209 aa  150  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8397  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  41.33 
 
 
238 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1196  beta-lactamase domain protein  35 
 
 
235 aa  136  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269825  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  41.24 
 
 
219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  42.08 
 
 
195 aa  132  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3834  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase  39.49 
 
 
339 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.537571 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  36.7 
 
 
212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  41.27 
 
 
209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  34.03 
 
 
212 aa  122  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  36.79 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  39.38 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  36.79 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  36.17 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  36.6 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  35.98 
 
 
208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  37.56 
 
 
214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  36.6 
 
 
209 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  36.08 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  36.08 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  36.27 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  35.75 
 
 
209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0512  Zn-dependent hydrolase  35.68 
 
 
275 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  37.31 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  36.27 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  36.51 
 
 
209 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  35.23 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  38.5 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  36.32 
 
 
205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  36.92 
 
 
210 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0797  beta-lactamase domain-containing protein  35.51 
 
 
238 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 
210 aa  112  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  38.74 
 
 
225 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  35.98 
 
 
209 aa  111  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  37.89 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  37.38 
 
 
231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1819  beta-lactamase domain-containing protein  35.48 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368429  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  35.26 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.92 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  36.9 
 
 
214 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  38.62 
 
 
207 aa  109  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  36.9 
 
 
215 aa  109  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  36.36 
 
 
214 aa  108  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4417  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 
214 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834565  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  33.5 
 
 
213 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  34.21 
 
 
209 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  34.29 
 
 
215 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  34.29 
 
 
215 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  34.86 
 
 
215 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  34.29 
 
 
215 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  35.23 
 
 
212 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  34.29 
 
 
215 aa  106  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  37.7 
 
 
225 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  39.23 
 
 
201 aa  106  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 
215 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1608  beta-lactamase domain-containing protein  37.36 
 
 
206 aa  107  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.130416  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  37.7 
 
 
225 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  35.6 
 
 
201 aa  106  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0811  beta-lactamase domain-containing protein  35.83 
 
 
214 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  34.29 
 
 
215 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  35.23 
 
 
205 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  34.29 
 
 
215 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  34.29 
 
 
215 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  40.21 
 
 
226 aa  105  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  34.29 
 
 
215 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  36.9 
 
 
213 aa  105  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  36.36 
 
 
207 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.43 
 
 
215 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.43 
 
 
215 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>