More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3705 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3847  Glycine hydroxymethyltransferase  73.89 
 
 
420 aa  639    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2884  Glycine hydroxymethyltransferase  75.64 
 
 
442 aa  641    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13350  serine hydroxymethyltransferase  79.43 
 
 
423 aa  662    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3596  Glycine hydroxymethyltransferase  86.53 
 
 
447 aa  756    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0535  Glycine hydroxymethyltransferase  76.74 
 
 
434 aa  659    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0767  serine hydroxymethyltransferase  75.46 
 
 
445 aa  659    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3705  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
453 aa  918    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2353  serine hydroxymethyltransferase  75.06 
 
 
423 aa  623  1e-177  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0383526  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1189  serine hydroxymethyltransferase  72.39 
 
 
432 aa  622  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000045975 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1663  Glycine hydroxymethyltransferase  69.77 
 
 
435 aa  621  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0424  Glycine hydroxymethyltransferase  72.96 
 
 
422 aa  615  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3186  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1115  serine hydroxymethyltransferase  71.4 
 
 
435 aa  615  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234213  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18800  serine hydroxymethyltransferase  73.87 
 
 
412 aa  612  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2501  Glycine hydroxymethyltransferase  69.21 
 
 
427 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0657  Glycine hydroxymethyltransferase  73.26 
 
 
452 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3130  Glycine hydroxymethyltransferase  70.7 
 
 
432 aa  601  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10070  serine hydroxymethyltransferase  68.74 
 
 
425 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.9411  normal  0.116151 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0694  serine hydroxymethyltransferase  69.61 
 
 
429 aa  602  1.0000000000000001e-171  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11114  serine hydroxymethyltransferase  69.93 
 
 
426 aa  595  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000666035  normal  0.472146 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27940  serine hydroxymethyltransferase  68.21 
 
 
430 aa  591  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.958283  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4629  Glycine hydroxymethyltransferase  69.61 
 
 
430 aa  591  1e-168  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0754  Glycine hydroxymethyltransferase  67.98 
 
 
428 aa  587  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128225  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04680  serine hydroxymethyltransferase  68.01 
 
 
426 aa  583  1.0000000000000001e-165  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5659  Glycine hydroxymethyltransferase  73.5 
 
 
421 aa  581  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21370  serine hydroxymethyltransferase  67.98 
 
 
422 aa  578  1e-164  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.100651  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3981  Glycine hydroxymethyltransferase  71.16 
 
 
434 aa  570  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.638114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2989  Glycine hydroxymethyltransferase  67.9 
 
 
440 aa  555  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0469  serine hydroxymethyltransferase  65.96 
 
 
474 aa  556  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996315  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  59.2 
 
 
415 aa  510  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 
415 aa  511  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  59.02 
 
 
413 aa  510  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  60.14 
 
 
415 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  58.25 
 
 
415 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  58.29 
 
 
415 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  58.56 
 
 
417 aa  501  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 
417 aa  504  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  58.55 
 
 
412 aa  501  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  58.39 
 
 
415 aa  500  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  58.53 
 
 
415 aa  501  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  58.29 
 
 
413 aa  496  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  58.37 
 
 
431 aa  497  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  57.37 
 
 
417 aa  496  1e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  58.37 
 
 
431 aa  495  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  58.22 
 
 
418 aa  496  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  57.92 
 
 
412 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  56.41 
 
 
416 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  62.72 
 
 
415 aa  491  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  57.92 
 
 
412 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  55.63 
 
 
415 aa  493  9.999999999999999e-139  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  57.85 
 
 
434 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  58.47 
 
 
412 aa  488  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  57.61 
 
 
438 aa  488  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  57.08 
 
 
415 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  57.65 
 
 
417 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  58.04 
 
 
439 aa  489  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  57.08 
 
 
415 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  57.08 
 
 
415 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  57.38 
 
 
413 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  57.08 
 
 
415 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  59.11 
 
 
431 aa  491  1e-137  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  59.38 
 
 
417 aa  489  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  56.84 
 
 
415 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  57.65 
 
 
417 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  57.08 
 
 
415 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  57.08 
 
 
415 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  57.08 
 
 
415 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  57.48 
 
 
434 aa  487  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  57.48 
 
 
434 aa  487  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  58.04 
 
 
438 aa  485  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 
413 aa  486  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  59.67 
 
 
420 aa  485  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  56.81 
 
 
414 aa  486  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0603  serine hydroxymethyltransferase  57.04 
 
 
416 aa  487  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  57.44 
 
 
431 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  58.29 
 
 
417 aa  485  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  58.73 
 
 
417 aa  485  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  57.21 
 
 
431 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  58.41 
 
 
429 aa  486  1e-136  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  55.9 
 
 
412 aa  487  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  59.19 
 
 
430 aa  487  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  59.81 
 
 
411 aa  485  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 
413 aa  488  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  60.14 
 
 
440 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  57.18 
 
 
432 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  56.91 
 
 
413 aa  485  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  57.94 
 
 
437 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  57.18 
 
 
417 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  59.06 
 
 
417 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  56.16 
 
 
413 aa  482  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  58.04 
 
 
438 aa  484  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  56.06 
 
 
411 aa  481  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  56.48 
 
 
432 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  56.91 
 
 
413 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  56.67 
 
 
413 aa  481  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  56.61 
 
 
422 aa  481  1e-135  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  57.61 
 
 
417 aa  483  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  59.81 
 
 
433 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  57.92 
 
 
433 aa  484  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  57.08 
 
 
415 aa  482  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  57.08 
 
 
415 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>