More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3686 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
310 aa  614  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.53 
 
 
308 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.53 
 
 
308 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.853442  normal  0.685254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.53 
 
 
308 aa  235  6e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172958  normal  0.378531 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06500  carbohydrate ABC transporter membrane protein  43.66 
 
 
321 aa  235  9e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20480  carbohydrate ABC transporter membrane protein  43.1 
 
 
318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0521728  normal  0.389193 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0281  ABC transporter, inner membrane subunit  42.62 
 
 
292 aa  230  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.82 
 
 
318 aa  228  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3852  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.25 
 
 
310 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0634568 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.58 
 
 
310 aa  226  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.25 
 
 
310 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.944367  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.56 
 
 
307 aa  224  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.96 
 
 
299 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190071 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
388 aa  222  6e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.69 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.292649  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.76 
 
 
435 aa  219  5e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.29 
 
 
306 aa  219  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.306567  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 
338 aa  218  7.999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0789775 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.26 
 
 
300 aa  218  7.999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000378352  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.76 
 
 
299 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.66 
 
 
320 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11261  sugar-transport integral membrane protein ABC transporter sugA  41.46 
 
 
307 aa  218  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00812399 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.85 
 
 
324 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.55 
 
 
312 aa  215  9e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.54 
 
 
331 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.24 
 
 
292 aa  212  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0233696  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 
320 aa  209  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.227719  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.83 
 
 
319 aa  209  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32149  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0305  sugar ABC transporter, permease protein  40.28 
 
 
325 aa  209  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474821  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0280  sugar ABC transporter, permease protein  40.28 
 
 
325 aa  209  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.39 
 
 
330 aa  208  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.36 
 
 
295 aa  207  1e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.982578  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
303 aa  206  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.236219 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.73 
 
 
328 aa  205  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0624  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.94 
 
 
345 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.65014 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.85 
 
 
296 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 
293 aa  204  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.215175  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38 
 
 
304 aa  203  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
320 aa  201  9e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0272526  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.59 
 
 
328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511246  normal  0.17987 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 
293 aa  200  3e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0994152  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 
293 aa  200  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.96 
 
 
320 aa  199  7e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.158412  hitchhiker  0.000108715 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
315 aa  196  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
315 aa  196  5.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273483  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0761  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.51 
 
 
320 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0629996  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.5 
 
 
330 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0584633  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.21 
 
 
308 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.51 
 
 
427 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000129291  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.07 
 
 
355 aa  187  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
309 aa  187  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.84 
 
 
294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0949  permease protein of sugar ABC transporter  42.31 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688345  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.66 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00180742  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04590  permease component of ABC-type sugar transporter  38.97 
 
 
323 aa  181  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359187  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.68 
 
 
301 aa  179  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2171  carbohydrate ABC transporter permease  35.91 
 
 
280 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0580768  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
297 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.439093 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2083  carbohydrate ABC transporter permease  37.27 
 
 
286 aa  176  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0183943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0888  sugar ABC transporter, permease protein  42.51 
 
 
320 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392731  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
313 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2279  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.27 
 
 
286 aa  175  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.32 
 
 
345 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
323 aa  172  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.68 
 
 
299 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.610005  normal  0.71076 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.05 
 
 
293 aa  170  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000240561  normal  0.90976 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 
304 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44429  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.568052  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.394829 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0867066 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
306 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1755  ABC transporter permease  35.27 
 
 
312 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.576454  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  37.5 
 
 
317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.39 
 
 
305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
312 aa  162  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
305 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.402925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 
357 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0548  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpA  36.51 
 
 
288 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  35.49 
 
 
307 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
318 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.49 
 
 
307 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.33 
 
 
286 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262739  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 
316 aa  158  9e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.130846  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
300 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114019  normal  0.0892858 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0079  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.93 
 
 
304 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.15 
 
 
316 aa  158  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  32.2 
 
 
318 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.14 
 
 
307 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
318 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
295 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0832027  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0144983  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.76 
 
 
307 aa  155  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
305 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536489  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
287 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
318 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
262 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.772214  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
318 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0625824  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3555  putative ABC transporter permease protein  32.52 
 
 
317 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>